Stat6  6778       P42226 PD-00666A Jak/Stat Pathway WB IHC ICC IP H M 1mg/ml 100ul
ATF-2   1386       P15336 PD-00667A MAPK Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
ATF-2   1386       P15336 PD-00668A MAPK Signaling WB IHC ICC IP H 1mg/ml 100ul
Cyclin D2    894       P30279 PD-00669A Cell Cycle IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
FADD    8772       Q13158 PD-00670A Apoptosis/Autophagy WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
FADD    8772       Q13158 PD-00671A Apoptosis/Autophagy WB IHC ICC IP H 1mg/ml 100ul
CD34   947 385 NP_001020280.1  NP_001764.1   NM_001025109.1  NM_001773.2   P28906 PD-00672A Lymphocyte Signaling WB FC H 1mg/ml 100ul
CD34   947 385 NP_001020280.1  NP_001764.1   NM_001025109.1  NM_001773.2   P28906 PD-00673A Lymphocyte Signaling WB IHC H 1mg/ml 100ul
CD34   947 385 NP_001020280.1  NP_001764.1   NM_001025109.1  NM_001773.2   P28906 PD-00674A Lymphocyte Signaling WB IHC ICC IP FC H 1mg/ml 100ul
eIF2α   1965       P05198 PD-00675A Translational Control WB IHC IF H 1mg/ml 100ul
SRC-1   8648       Q15788 PD-00676A Chromatin Regulation  WB H 1mg/ml 100ul
ALK   238       Q9UM73 PD-00677A Tyrosine Kinase WB H 1mg/ml 100ul
Annexin A1  301       P04083 PD-00678A Ca Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
Annexin A1  301       P04083 PD-00679A Ca Signaling WB IHC ICC IF H 1mg/ml 100ul
SOCS3   9021       O14543 PD-00680A Tyrosine Kinase WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
Vav1   7409       P15498 PD-00681A Cytoskeletal Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Vav1   7409       P15498 PD-00682A Cytoskeletal Signaling WB ICC IP H 1mg/ml 100ul
MSH6   2956       P52701 PD-00683A Cell Cycle WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
MSH6   2956       P52701 PD-00684A Cell Cycle WB IHC IP H M 1mg/ml 100ul
JunB   3726       P17275 PD-00685A Lymphocyte Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
JunB   3726       P17275 PD-00686A Lymphocyte Signaling WB ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
TrkC   4916       Q16288 PD-00687A Neuroscience WB IHC H 1mg/ml 100ul
ERCC1  2067       P07992 PD-00688A DNA Damage WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
ERCC1  2067       P07992 PD-00689A DNA Damage WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
GAD2  2572       Q05329 PD-00690A Neuroscience WB IHC IF H 1mg/ml 100ul
GAD2  2572       Q05329 PD-00691A Neuroscience WB H M R 1mg/ml 100ul
Integrin αV  3685       P06756 PD-00692A Angiogenesis WB FC H M R 1mg/ml 100ul
p95/NBS1  4683       O60934 PD-00693A DNA Damage WB IF FC H 1mg/ml 100ul
p95/NBS1  4683       O60934 PD-00694A DNA Damage WB H M R 1mg/ml 100ul
p95/NBS1  4683       O60934 PD-00695A DNA Damage WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
MyD88  4615       Q99836 PD-00696A Lymphocyte Signaling WB IHC FC H M 1mg/ml 100ul
MyD88  4615       Q99836 PD-00697A Lymphocyte Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
4E-BP1   1978   NP_004086.1   Q13541 PD-00698A Translational Control WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
Non4E-BP1    1978   NP_004086.1   Q13541 PD-00699A AKT Signaling WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
Elk-1  2002   NP_005220   P19419 PD-00700A MAPK Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
Elk-1  2002   NP_005220   P19419 PD-00701A MAPK Signaling WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
AMPKα2  5563       P54646 PD-00702A Glucose Metabolism WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
AMPKα2  5563       P54646 PD-00703A Glucose Metabolism WB IF H M R 1mg/ml 100ul
RECK    8434       O95980 PD-00704A Protein Folding/Stability WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
RECK    8434       O95980 PD-00705A Protein Folding/Stability WB H M R 1mg/ml 100ul
SNAP25   6616       P60880 PD-00706A Vesicle Trafficking WB H M R 1mg/ml 100ul
SNAP25   6616       P60880 PD-00707A Vesicle Trafficking WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
SNAP25   6616       P60880 PD-00708A Vesicle Trafficking WB ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
PKA C   5566       P17612 PD-00709A Ca Signaling WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
PKA Cα  5566       P17612 PD-00710A Ca Signaling WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
IRS-2   8660       Q9Y4H2 PD-00711A Glucose Metabolism WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
PGC1α  10891       Q9UBK2 PD-00712A Glucose Metabolism WB FC H 1mg/ml 100ul
Calbindin   793       P05937 PD-00713A Ca Signaling WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
Calnexin       821       P27824 PD-00714A Protein Folding/Stability WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
Cdx2  1045       Q99626 PD-00715A Wnt Signaling WB IHC ICC FC H 1mg/ml 100ul
TRAF6  7189       Q9Y4K3 PD-00716A Apoptosis/Autophagy WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
TRAF6  7189       Q9Y4K3 PD-00717A Apoptosis/Autophagy WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
Integrin α6  3655       P23229 PD-00718A Adhesion WB IHC H 1mg/ml 100ul
PAK1 5058       Q13153 PD-00719A Cytoskeletal Signaling WB IHC H 1mg/ml 100ul
PAK1  5058       Q13153 PD-00720A Cytoskeletal Signaling WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
VDAC  7416       P21796 PD-00721A Cytoskeletal Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
AIF  9131       O95831 PD-00722A Apoptosis/Autophagy WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Caspase-2   835        P42575 PD-00723A Apoptosis/Autophagy WB H M R 1mg/ml 100ul
WASP  7454       P42768 PD-00724A Cytoskeletal Signaling WB IHC FC H M 1mg/ml 100ul
HSL  3991       Q05469 PD-00725A Glucose Metabolism WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
HSF1  3297       Q00613 PD-00726A Protein Folding/Stability WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
IRF-3  3661       Q14653 PD-00727A NF-KB Signaling WB IHC IF H 1mg/ml 100ul
PLK1   5347       P53350 PD-00728A Cell Cycle WB IHC H 1mg/ml 100ul
Rap1A 5906       P62834 PD-00729A Cytoskeletal Signaling WB IHC FC H M R 1mg/ml 100ul
Ran  5901       P62826 PD-00730A Cytoskeletal Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
SOCS1   8651       O15524 PD-00731A Lymphocyte Signaling WB IHC IF FC H M 1mg/ml 100ul
TACE  6868       P78536 PD-00732A Neuroscience WB H M R 1mg/ml 100ul
GRK2  156       P25098 PD-00733A Neuroscience WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Acetyl-Histone H2A   3014   NP_002096.1   P16104 PD-00734A Chromatin Regulation  WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Histone H2A.X   3014   NP_002096.1   P16104 PD-00735A Apoptosis/Autophagy WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
SUMO-1   7341 101 NP_001005781.1  NP_001005782.1  NP_003343.1   NM_001005781.1  NM_001005782.1  NM_003352.4   P63165 PD-00736A Protein Folding/Stability WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
PTCH1   5727        Q13635 PD-00737A Wnt Signaling WB IHC H M 1mg/ml 100ul
RANK Ligand   8600       O14788 PD-00738A Apoptosis/Autophagy WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
Catenin δ-1   1500       O60716 PD-00739A Adhesion WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
PKC zeta  5590       Q05513 PD-00740A Ca Signaling WB IHC H 1mg/ml 100ul
PKCζ   5590       Q05513 PD-00741A Ca Signaling IHC H M R 1mg/ml 100ul
eEF1A    1915       P68104 PD-00742A Translational Control WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
Integrin α5  3678       P08648 PD-00743A Angiogenesis WB H M R 1mg/ml 100ul
c-IAP2   330       Q13489 PD-00744A Apoptosis/Autophagy IHC H M R 1mg/ml 100ul
PDK1  5163       O15530 PD-00745A AKT Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
PDK1 Docking Motif   5163       O15530 PD-00746A AKT Signaling WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
GADD45 α 1647       P24522 PD-00747A Cell Cycle WB H M R 1mg/ml 100ul
NMDAR1  2902       Q05586 PD-00748A Neuroscience WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
SEK1   6416   NP_003001   P45985 PD-00749A MAPK Signaling WB IHC H 1mg/ml 100ul
SEK1/MKK4  6416   NP_003001   P45985 PD-00750A MAPK Signaling WB IHC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
TGM2    7052       P21980 PD-00751A Ca Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
Cortactin   2017       Q14247 PD-00752A Cytoskeletal Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Skp2   6502        Q13309 PD-00753A Protein Folding/Stability WB  H M R 1mg/ml 100ul
Nur77    3164       P22736 PD-00754A Lymphocyte Signaling WB FC H M R 1mg/ml 100ul
LKB1   6794       Q15831 PD-00755A Glucose Metabolism WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
MEF2A  4205       Q02078 PD-00756A MAPK Signaling WB IHC ICC FC H M R 1mg/ml 100ul
AMPKβ1   5564       Q9Y478 PD-00757A Glucose Metabolism WB IHC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
Moesin    4478       P26038 PD-00758A Cytoskeletal Signaling WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
Moesin   4478       P26038 PD-00759A Cytoskeletal Signaling WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
Acetyl-Histone H4   121504       P62805 PD-00760A Chromatin Regulation  WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
Di-Methyl-Histone H4   121504       P62805 PD-00761A Chromatin Regulation  WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
Histone H4   121504       P62805 PD-00762A Chromatin Regulation  WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
PRKG1 5592       Q13976 PD-00763A Cytoskeletal Signaling WB ICC IF H 1mg/ml 100ul
Smac/Diablo  56616       Q9NR28 PD-00764A Apoptosis/Autophagy WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
CHOP   1649 169 NP_001181982.1  NP_001181983.1  NP_001181984.1  NP_001181985.1  NP_001181986.1  NP_004074.2 NM_001195053.1  NM_001195054.1  NM_001195055.1  NM_001195056.1  NM_001195057.1  NM_004083.5   P35638 PD-00765A Translational Control WB H M R 1mg/ml 100ul
p130 Cas   9564       P56945 PD-00766A Tyrosine Kinase WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
YY1   7528       P25490 PD-00767A Apoptosis/Autophagy WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
Integrin β4  3691       P16144 PD-00768A Adhesion WB H M R 1mg/ml 100ul
PI3 Kinase p110β   5291       P42338 PD-00769A AKT Signaling WB IHC H 1mg/ml 100ul
LRRK2  120892       Q5S007 PD-00770A Neuroscience WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
PSD95   1742       P78352 PD-00771A Neuroscience WB ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
HIF-1β/ARNT   405       P27540 PD-00772A Angiogenesis WB H M 1mg/ml 100ul
ATR   545       Q13535 PD-00773A Cell Cycle WB IHC H 1mg/ml 100ul
IP3 Receptor  3708       Q14643 PD-00774A Ca Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
DNA-PK  731751       P78527 PD-00775A Cell Cycle WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
AMACR   23600       Q9UHK6 PD-00776A Glucose Metabolism WB IHC IF FC H 1mg/ml 100ul
c-IAP1  329       Q13490 PD-00777A Apoptosis/Autophagy WB IHC H M 1mg/ml 100ul
HDAC2  3066       Q92769 PD-00778A Chromatin Regulation  WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
CrkII   1398       P46108 PD-00779A Tyrosine Kinase WB ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
Tyk2  7297       P29597 PD-00780A Tyrosine Kinase WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
PKCε   5581       Q02156 PD-00781A Ca Signaling WB IHC ICC FC H M R 1mg/ml 100ul
PCAF   8850       Q92831 PD-00782A Chromatin Regulation  WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Tollip  54472       Q9H0E2 PD-00783A NF-KB Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
GPX1   2876       P07203 PD-00784A Lymphocyte Signaling WB IHC IF FC H M 1mg/ml 100ul
RPA70   6117       P27694 PD-00785A Cell Cycle WB IHC ICC IP FC H 1mg/ml 100ul
TRAF3  7187       Q13114 PD-00786A Apoptosis/Autophagy WB H M R 1mg/ml 100ul
MKP1    1843       P28562 PD-00787A MAPK Signaling WB IF H 1mg/ml 100ul
SRC-3   8202       Q9Y6Q9 PD-00788A Chromatin Regulation  WB IHC ICC FC H 1mg/ml 100ul
ASM  6609       P17405 PD-00789A Ca Signaling WB IHC H 1mg/ml 100ul
Grp94        7184       P14625 PD-00790A Protein Folding/Stability WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
p67phox  4688       P19878 PD-00791A Lymphocyte Signaling WB IHC ICC IP H M R 1mg/ml 100ul
eIF4G1  1981       Q04637 PD-00792A Translational Control WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
Maspin   5268       P36952 PD-00793A Angiogenesis WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Ku70   2547       P12956 PD-00794A Cell Cycle WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Ku80   7520       P13010 PD-00795A Lymphocyte Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
FoxO1   2308       Q12778 PD-00796A AKT Signaling WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
CDK9   1025       P50750 PD-00797A Cell Cycle WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Brg1   6597       P51532 PD-00798A Chromatin Regulation  WB H M R 1mg/ml 100ul
Aurora A/AIK   6790       O14965 PD-00799A Cell Cycle WB ICC FC H M 1mg/ml 100ul
p57 Kip2  1028       P49918 PD-00800A Cell Cycle WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
NMDAR2B   2904       Q13224 PD-00801A Neuroscience WB H M R 1mg/ml 100ul
Caspase-6  839       P55212 PD-00802A Apoptosis/Autophagy WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
c-Rel  5966       Q04864 PD-00803A NF-KB Signaling WB IHC ICC IP  H 1mg/ml 100ul
IRAK1   3654       P51617 PD-00804A NF-KB Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
Stathmin  3925       P16949 PD-00805A Cytoskeletal Signaling WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
EpCAM   4072       P16422 PD-00806A Cytoskeletal Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
cdc25A  993       P30304 PD-00807A Cell Cycle WB H 1mg/ml 100ul
Enolase-1  2023       P06733 PD-00808A Glucose Metabolism WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
Hck  3055       P08631 PD-00809A Tyrosine Kinase WB ICC IP FC H 1mg/ml 100ul
AID   57379       Q9GZX7 PD-00810A Lymphocyte Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
Calpain 2 Large Subunit       824       P17655 PD-00811A Protein Folding/Stability WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
ILK1   3611       Q13418 PD-00812A Adhesion WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
DAPK1  1612       P53355 PD-00813A Apoptosis/Autophagy WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
C/EBPalpha   1050       P49715 PD-00814A Glucose Metabolism WB H M R 1mg/ml 100ul
C/EBPα  1050       P49715 PD-00815A Lymphocyte Signaling WB ICC IP FC H 1mg/ml 100ul
DNMT3B  1789       Q9UBC3 PD-00816A Chromatin Regulation  WB IHC H 1mg/ml 100ul
PKA RI-α 5573       P10644 PD-00817A Ca Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
Radixin  5962       P35241 PD-00818A Cytoskeletal Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Radixin   5962       P35241 PD-00819A Cytoskeletal Signaling WB IHC ICC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
LEF1   51176       Q9UJU2 PD-00820A Wnt Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
EAAT2  6506       P43004 PD-00821A Neuroscience WB H 1mg/ml 100ul
CDK7  1022       P50613 PD-00822A Cell Cycle WB IHC H 1mg/ml 100ul
Human Neurotrophin-4  4909   NP_006170.1  NM_006179.4   P34130 PD-00823A Neuroscience WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
Stat2  6773       P52630 PD-00824A Jak/Stat Pathway WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
DJ-1  11315       Q99497 PD-00825A AKT Signaling WB IHC ICC IP  H M R 1mg/ml 100ul
P-Cadherin   1001       P22223 PD-00826A Adhesion WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
GATA-2  2624 480AA NP_001139133.1  NP_001139134.1  NP_116027.2   NM_001145661.1  NM_001145662.1  NM_032638.4   P23769 PD-00827A Lymphocyte Signaling WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
IKKγ   8517 419 NP_001093326.2  NP_001093327.1  NP_001138727.1  NP_003630.1  NM_001099856.2  NM_001099857.1  NM_001145255.1  NM_003639.3   Q9Y6K9 PD-00828A NF-KB Signaling WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
HDAC3   8841 428 NP_003874.2   NM_003883.3   O15379 PD-00829A Chromatin Regulation  WB IHC ICC IP  H M R 1mg/ml 100ul
Smad1 4086       Q15797 PD-00830A TGF Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
Smad1  4086       Q15797 PD-00831A TGF Signaling WB IHC ICC FC H 1mg/ml 100ul
Calpain 1 Large Subunit      823       P07384 PD-00832A Protein Folding/Stability WB IHC ICC FC H M R 1mg/ml 100ul
PLD1  5337       Q13393 PD-00833A Ca Signaling WB H M R 1mg/ml 100ul
TAK1  6885   NP_003179   O43318 PD-00834A MAPK Signaling WB IHC ICC H M R 1mg/ml 100ul
NMDAR2A  2903       Q12879 PD-00835A Neuroscience WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
βIG-H3  7045       Q15582 PD-00836A Adhesion WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
NSF    4905       P46459 PD-00837A Vesicle Trafficking WB H 1mg/ml 100ul
Filamin A  2316       P21333 PD-00838A Cytoskeletal Signaling WB IHC ICC FC H M R 1mg/ml 100ul
PLCγ2  5336       P16885 PD-00839A Ca Signaling WB IHC IP FC H 1mg/ml 100ul
Notch3   4854       Q9UM47 PD-00840A Neuroscience WB H M R 1mg/ml 100ul
PERK   9451       Q9NZJ5 PD-00841A Translational Control WB H M R 1mg/ml 100ul
Arf6   382       P62330 PD-00842A Protein Folding/Stability WB IHC FC H M 1mg/ml 100ul
S6 Ribosomal Protein    6194       P62753 PD-00843A Translational Control WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
SGK  6446       O00141 PD-00844A Glucose Metabolism WB IHC IP FC H M R 1mg/ml 100ul
KCNE1  3753       P15382 PD-00845A Neuroscience WB IF H M R 1mg/ml 100ul
Rpb1 CTD   5430       P24928 PD-00846A Translational Control WB ICC FC H 1mg/ml 100ul
MARCKS   4082       P29966 PD-00847A Ca Signaling WB IHC ICC FC H 1mg/ml 100ul
PKM2  5315 531AA NP_002645.3  NP_872270.1  NP_872271.1   NM_002654.3  NM_182470.1  NM_182471.1   P14618 PD-00848A Glucose Metabolism WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
HLA-C 3105   NP_001229687.1  NP_002107.3 NM_001242758.1  NM_002116.7   PD-00849A Cardiovascular Diseases WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
CSNK2A1 1457   NP_001886.1  NP_808227.1  NP_808228.1   NM_001895.3  NM_177559.2  NM_177560.2   P68400 PD-00850A Infectious Diseases WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
SERPINA1 5265   NP_000286.3 NP_001002235.1  NP_001002236.1  NP_001121172.1  NP_001121173.1  NP_001121174.1  NP_001121175.1  NP_001121176.1 
    NP_001121177.1  NP_001121178.1  NP_001121179.1  
NM_000295.4 NM_001002235.2 NM_001002236.2  NM_001127700.1  NM_001127701.1  NM_001127702.1  NM_001127703.1  NM_001127704.1 
    NM_001127705.1  NM_001127706.1  NM_001127707.1  
P01009 PD-00851A Immune System WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
XRCC3 7517   NP_001093588.1  NP_001093589.1  NP_005423.1 NM_001100118.1  NM_001100119.1  NM_005432.3   O43542 PD-00852A Folding, Sorting and Degradation  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
TPMT 7172   NP_000358.1   NM_000367.2   P51580 PD-00853A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
CNP 1267   NP_149124.3  NM_033133.4 P09543 PD-00854A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
ADA 100   NP_000013.2 NM_000022.2   P00813 PD-00855A Immune Diseases  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
AurkB 9212   NP_004208.2   NM_004217.2   Q96GD4  PD-00856A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
SERPINA3 12   NP_001076.2  NM_001085.4  P01011 PD-00857A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
KRT18 3875   NP_000215.1  NP_954657.1   NM_000224.2  NM_199187.1   P05783 PD-00858A Infectious Diseases WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
YWHAB 7529   NP_003395.1  NP_647539.1  NM_003404.3  NM_139323.2  P31946 PD-00859A Nervous System WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
KRT8 3856   NP_002264.1   NM_002273.3   P05787 PD-00860A Plasma membrane WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
SGK1 6446   NP_001137148.1  NP_001137149.1  NP_001137150.1  NP_005618.2   NM_001143676.1  NM_001143677.1  NM_001143678.1  NM_005627.3   O00141    PD-00861A  Excretory System WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
SFN 2810   NP_006133.1 NM_006142.3  P31947 PD-00862A  Excretory System WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
HTRA1 5654   NP_002766.1   NM_002775.4   Q92743    PD-00863A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
GJB6 10804   NP_001103689.1  NP_001103690.1  NP_001103691.1  NP_006774.2   NM_001110219.2  NM_001110220.2  NM_001110221.2  NM_006783.4   O95452 PD-00864A Cell Cycle  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
SDHB 6390   NP_002991.2   NM_003000.2   P21912   PD-00865A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
TPM1 7168   NP_000357.3  NP_001018004.1  NP_001018005.1  NP_001018006.1  NP_001018007.1  NP_001018008.1  NP_001018020.1  NM_000366.5  NM_001018004.1  NM_001018005.1  NM_001018006.1  NM_001018007.1  NM_001018008.1  NM_001018020.1 P09493 PD-00866A Cardiovascular Diseases WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
CA1 759   NP_001122301.1  NP_001122302.1  NP_001122303.1  NP_001158302.1  NP_001729.1 NM_001128829.2  NM_001128830.2  NM_001128831.2  NM_001164830.1  NM_001738.3 P00915 PD-00867A Energy Metabolism WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
DFFA 1676   NP_004392.1  NP_998731.1  NM_004401.2  NM_213566.1 O00273 PD-00868A Cell Growth and Death WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
ENO1 2023       NP_001188412.1  NP_001419.1   NM_001201483.1  NM_001428.3   P06733  PD-00869A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
RAD23B 5887   NP_002865.1 NM_002874.3 P54727 PD-00870A Folding, Sorting and Degradation  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
STAR 6770   NP_000340.2 NM_000349.2 P49675 PD-00871A Transporter WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
SERPINA5 5104   NP_000615.3   NM_000624.4   P05154 PD-00872A Immune System WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
GSTO1 9446   NP_001177931.1  NP_001177932.1  NP_004823.1 NM_001191002.1  NM_001191003.1  NM_004832.2   P78417    PD-00873A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
GCLC 2729   NP_001184044.1  NP_001489.1   NM_001197115.1  NM_001498.3   P48506 PD-00874A Metabolism of Other Amino Acids  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
BGN 633   NP_001702.1 NM_001711.4 P21810 PD-00875A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
PSMC1 5700   NP_002793.2  NM_002802.2  P62191 PD-00876A Folding, Sorting and Degradation  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
CTBP2 1488   NP_001077383.1  NP_001320.1  NP_073713.2 NM_001083914.1  NM_001329.2  NM_022802.2 P56545 PD-00877A Cancers WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
MAPK11 5600   NP_002742.3   NM_002751.5   Q15759 PD-00878A Infectious Diseases WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
PSMB1 5689   NP_002784.1 NM_002793.3 P20618 PD-00879A Folding, Sorting and Degradation  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
PCBP1 5093   NP_006187.2 NM_006196.3 Q15365 PD-00880A Transcription  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
EDN3 1908   NP_000105.1  NP_996915.1  NP_996916.1  NP_996917.1   NM_000114.2  NM_207032.1  NM_207033.1  NM_207034.1   P14138 PD-00881A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
U2AF1 7307   NP_001020374.1  NP_001020375.1  NP_006749.1 NM_001025203.1  NM_001025204.1  NM_006758.2  Q01081 PD-00882A Infectious Diseases WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
RAD1 5810   NP_002844.1  NM_002853.3 O60671 PD-00883A Cell Cycle  WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
AKR1C2 1646   NP_001128713.1  NP_001345.1  NP_995317.1   NM_001135241.1  NM_001354.4  NM_205845.1   P52895 PD-00884A  Lipid Metabolism WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
MTAP 4507   NP_002442.2   NM_002451.3   Q13126 PD-00885A Amino Acid Metabolism WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
M6PRBP1 10226   NP_001157661.1  NP_001157666.1  NP_005808.3   NM_001164189.1  NM_001164194.1  NM_005817.4   O60664 PD-00886A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
IκBα    4792       P25963 PD-00887A NF-KB Signaling WB IHC IF IP H M R 1mg/ml 100ul
HNF4α   3172       P41235 PD-00888A Glucose Metabolism WB IHC ICC IP Fc H 1mg/ml 100ul
FGF Receptor 4  2264       P22455 PD-00889A Tyrosine Kinase WB IHC FC H 1mg/ml 100ul
Smad1           PD-00890A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
Cox1  4512       P00395 PD-00891A NF-KB Signaling WB IHC IF IP FC H M R 1mg/ml 100ul
Tau           PD-00892A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
Bag-1           PD-00893A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
Bfl1 (N-term)           PD-00894A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
BCL-10           PD-00895A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
HDAC10           PD-00896A   WB IHC H M R  1mg/ml 100ul
Mouse anti GAPDH mAb           PD-00897A   WB   1mg/ml 100ul
Mouse anti β-actin mAb           PD-00898A   WB   1mg/ml 100ul
Rabbit anti β-actin pAb           PD-00899A   WB   1mg/ml 100ul
Rabbit anti Tubulin pAb           PD-00900A   WB、IF   1mg/ml 100ul
Mouse anti His mAb           PD-00901A   WB、IP、IF   1mg/ml 100ul
Mouse anti Flag mAb           PD-00902A   WB、IP、IF   1mg/ml 100ul
Rabbit anti GST pAb           PD-00903A   WB、IP、IF   1mg/ml 100ul
Mouse anti HA mAb           PD-00904A   WB、IP、IF   1mg/ml 100ul
Mouse anti c-myc mAb           PD-00905A   WB、IP、IF   1mg/ml 100ul
Rabbit anti GFP pAb           PD-00906A   WB、IP、IF   1mg/ml 100ul
Mouse anti GFP mAb           PD-00907A   WB、IF   1mg/ml 100ul
Rabbit Anti-proBNPantibody           PD-00908A       1mg/ml 100ul
Rabbit Anti-BNPantibody           PD-00909A       1mg/ml 100ul
PRMT5 Polyclonal Antibody     10419     PD-00910A   WB IHC IF IP ChIP H M R 1mg/ml 100ul
STUB1 Polyclonal Antibody     10273     PD-R00908A   WB  H M R 1mg/ml 100ul
BrdU Monoclonal Antibody           PD-00912A   IHC IF FC lododeoxyuridine 1mg/ml 100ul
CAD Polyclonal Antibody     790     PD-00913A   WB IHC  H 1mg/ml 100ul
CALD1 Polyclonal Antibody     800     PD-00914A   WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
CD14 Polyclonal Antibody     929     PD-00915A   WB IHC IF H 1mg/ml 100ul
CD163 Polyclonal Antibody     9332     PD-00916A   WB H M R 1mg/ml 100ul
CD22 Polyclonal Antibody     933     PD-00917A   WB IHC IF H M 1mg/ml 100ul
CD33 Polyclonal Antibody     945     PD-00918A   WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
CD38 Polyclonal Antibody     952     PD-00919A   WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
CD47 Polyclonal Antibody     961     PD-00920A   WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
Dnmt1 Polyclonal Antibody     1786     PD-00921A   WB IHC IF IP ChIP H M R 1mg/ml 100ul
DPP4 Polyclonal Antibody     1803     PD-00922A   WB H M R 1mg/ml 100ul
G6PD Polyclonal Antibody     2539     PD-00923A   WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
GAS6 Polyclonal Antibody     2621     PD-00924A   WB IHC H M 1mg/ml 100ul
IDS Polyclonal Antibody     3423     PD-00925A   WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
KEAP1 Polyclonal Antibody     9817     PD-00926A   WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
LGR5 Polyclonal Antibody     8549     PD-00927A   WB IHC IF FC H M 1mg/ml 100ul
LMNB1 Polyclonal Antibody     4001     PD-00928A   WB IHC IF H M R 1mg/ml 100ul
LOX Polyclonal Antibody     4015     PD-00929A   WB IHC H M R 1mg/ml 100ul
MFN2 Polyclonal Antibody     9927     PD-00930A   WB IHC IP H M R 1mg/ml 100ul
NOTCH4 Polyclonal Antibody     4855     PD-00931A   WB  H M R 1mg/ml 100ul
RAD51 Polyclonal Antibody     5888     PD-00932A   WB H M R 1mg/ml 100ul
SP1 Monoclonal Antibody     6667     PD-00933A   WB IF FC H 1mg/ml 100ul
SPN Polyclonal Antibody     6693     PD-00934A   WB IHC H 1mg/ml 100ul
TNFRSF8 Polyclonal Antibody     943     PD-00935A   WB IHC H 1mg/ml 100ul
TOMM20 Polyclonal Antibody     9804     PD-00936A   WB IHC IF IP H M R 1mg/ml 100ul
MKI67 Monoclonal Antibody     4288     PD-00937A   WB IHC ICC IF   1mg/ml 100ul
VEGFA Polyclonal Antibody     7422     PD-00938A   WB    1mg/ml 100ul
MITF Polyclonal Antibody     4286     PD-00939A   WB   1mg/ml 100ul
CD68/SR-D1 antibody(KP1)           PD-00940A         100ul
CD34  Polyclonal Antibody           PD-00941A         100ul
CD45 Polyclonal Antibody           PD-01042A         100ul
HRP2 Polyclonal Antibody           PD-01143A         100ul

COVID-19 Teşhisi için Test Teknikleri ve Test Geliştirme

Kaynak: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7197457/

ABD Gıda ve İlaç Dairesi (FDA), halka ve sağlık hizmeti sağlayıcılarına, şu anda izin verilen SARS-CoV-2 antikor testlerinden elde edilen sonuçların herhangi bir zamanda bir kişinin bağışıklık düzeyini veya COVID-19’dan korunma düzeyini değerlendirmek için kullanılmaması gerektiğini hatırlatıyor, ve özellikle kişi COVID-19 aşısı aldıktan sonra.

Pozitif bir antikor testi sonucu, daha önce SARS-CoV-2 enfeksiyonu geçirmiş olabilecek kişilerin belirlenmesine yardımcı olmak için kullanılabilirken, COVID-19 aşısı olan kişilerde daha fazla araştırmaya ihtiyaç vardır. Şu anda izin verilen SARS-CoV-2 antikor testleri, COVID-19 aşılamasına karşı bir bağışıklık yanıtının sağladığı koruma düzeyini değerlendirmek için değerlendirilmemiştir. Antikor testi sonuçları yanlış yorumlanırsa, insanların SARS-CoV-2 maruziyetine karşı daha az önlem alma olasılığı vardır. SARS-CoV-2’ye karşı korunmak için daha az adım atmak, SARS-CoV-2 enfeksiyonu riskini artırabilir ve SARS-CoV-2’nin yayılmasının artmasına neden olabilir.

FDA, COVID-19 aşısı olan kişilerde antikor testlerinin kullanımı hakkında halka ve sağlık hizmeti sağlayıcılarına ek bilgi ve öneriler sağlamaktadır.

SARS-CoV-2 Antikor Testi Olan veya Olabilecek Kişilere Öneriler
SARS-CoV-2 antikor testlerinin, sağlık hizmeti sağlayıcılarının, bir kişinin daha önce virüs bulaşmış olduğunu gösteren COVID-19’a neden olan virüs olan SARS-CoV-2’ye karşı antikorları olup olmadığını belirlemesine yardımcı olduğunu unutmayın. Bununla birlikte, pozitif veya negatif bir antikor testinin anlamını anlamak için, COVID-19 aşısı olan kişilerde, SARS-CoV-2’ye maruz kalmış ve SARS-CoV-2’ye sahip kişilerde de dahil olmak üzere antikorların varlığı veya yokluğunun ötesinde daha fazla araştırmaya ihtiyaç vardır. antikorlar ve tam olarak aşılanmamış kişilerde.
Aşılanmadıysanız: Bir antikor testinden elde edilen pozitif sonucun, belirli bir miktarda bağışıklığa veya SARS-CoV-2 enfeksiyonuna karşı korunmaya sahip olduğunuz anlamına gelmediğini unutmayın. SARS-CoV-2 antikor testinde pozitif bir test sonucunuz varsa, bu, daha önce SARS-CoV-2 virüsü bulaşmış olmanızın mümkün olduğu anlamına gelir. SARS-CoV-2 antikor testi sonuçlarınızın anlamı hakkında sağlık uzmanınızla konuşun.
COVID-19 aşısı aldıysanız: Tam aşılı kişiler için CDC’nin tavsiyelerine uymaya devam edin . SARS-CoV-2 antikor testinde pozitif bir test sonucunuz varsa, daha önce SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş olabilirsiniz. Bir COVID-19 aşısı, antikor testlerinin tümü olmasa da bazıları için pozitif antikor testi sonucuna da neden olabilir. SARS-CoV-2 antikor testinizin sonuçlarını, belirli bir bağışıklık seviyesinin veya SARS-CoV-2 enfeksiyonundan korunmanın bir göstergesi olarak yorumlamamalısınız. Bir antikor testinin sizin için uygun olup olmadığı konusunda sorularınız varsa, sağlık uzmanınızla veya eyalet ve yerel sağlık departmanlarınızla konuşun.
Sağlık Hizmeti Sağlayıcıları için Öneriler
Şu anda kalitatif, yarı kantitatif veya kantitatif SARS-CoV-2 antikor testlerinin sonuçlarını, kişi bir COVID aldıktan sonra belirli bir bağışıklık seviyesinin veya SARS-CoV-2 enfeksiyonundan korunmanın bir göstergesi olarak yorumlamayın. -19 aşı. Pozitif bir antikor testi, bir bağışıklık tepkisinin oluştuğunu (serokonversiyon) gösterebilse de ve böyle bir tepkinin tespit edilememesi, bir bağışıklık tepkisinin olmadığını gösterebilir, daha fazla araştırmaya ihtiyaç vardır. Şu anda izin verilen SARS-CoV-2 antikor testleri , spesifik bağışıklığı veya SARS-CoV-2 enfeksiyonundan korunmayı değerlendirmek için doğrulanmamıştır. SARS-CoV-2 antikor testleri, yalnızca testin kullanımına ve sınırlamalarına aşina olan sağlık hizmeti sağlayıcıları tarafından istenmelidir. SARS-CoV-2 için antikor testleri hakkında daha fazla bilgi için bkz.Seroloji/Antikor Testleri: SARS-CoV-2 Testine İlişkin SSS .
Aşıların spesifik viral protein hedeflerine karşı antikorları tetiklediğini unutmayın. Örneğin, şu anda izin verilen COVID-19 mRNA aşıları, muhtemelen yalnızca doğal enfeksiyonlardan sonra saptanan nükleokapsid proteinlerine değil, spike proteinine karşı antikorları indükler. Bu nedenle, antikor testi COVID-19 aşısının neden olduğu antikorları tespit etmezse, daha önce doğal enfeksiyon geçirmemiş olan COVID-19 aşılı kişiler negatif antikor testi sonucu alacaktır. Aşılı bireylerde antikor testi yaptırmayı düşünüyorsanız, Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezlerinin antikor testi yönergelerini izleyin . Antikor testi performansı hakkında daha fazla bilgi için EUA Yetkili Seroloji Test Performansı sayfasını ziyaret edin .
SARS-CoV-2 Antikor Test Sonuçlarının Uygunsuz Şekilde Kullanılmasının Potansiyel Riskleri
Antikorlar, enfekte veya aşı olduktan hemen sonra vücudunuzun bağışıklık sistemi tarafından oluşturulan proteinlerdir. SARS-CoV-2 antikoru veya seroloji testleri, bir kişinin geçmişte COVID-19’a neden olan virüsle enfeksiyon geçirip geçirmediğini belirlemek için bir kan örneğinde antikorları arar. Bu tür testler mevcut bir enfeksiyonu teşhis etmek için kullanılamaz. Antikor testi hakkında daha fazla bilgi için COVID-19 için Antikor (Seroloji) Testi: Hastalar ve Tüketiciler için Bilgiler bölümüne bakın .

Şu anda izin verilen SARS-CoV-2 antikor testlerinden elde edilen test sonuçları, bir kişinin bağışıklık düzeyini veya COVID-19’dan korunma düzeyini değerlendirmek için kullanılmamalıdır. Antikor testinin sonuçları, belirli bir bağışıklık düzeyinin veya SARS-CoV-2 enfeksiyonundan korunmanın bir göstergesi olarak yorumlanırsa, insanların SARS-CoV-2 maruziyetine karşı daha az önlem alma olasılığı vardır. SARS-CoV-2’ye maruz kalmaya karşı daha az önlem almak enfeksiyon riskini artırabilir ve SARS-CoV-2’nin yayılmasının artmasına neden olabilir.

FDA Eylemleri
FDA, yakın zamanda veya önceki bir enfeksiyondan SARS-CoV-2’ye karşı bağışıklık yanıtı olan kişileri belirlemek dışındaki amaçlar için yetkili SARS-CoV-2 antikor testlerinin kullanımını izlemeye devam edecektir.

FDA, SARS-CoV-2 antikor testleri hakkında güncel bilgiler sağladı ve yeni ek bilgiler ortaya çıkarsa sağlık hizmeti sağlayıcılarını ve halkı bilgilendirmeye devam edecek. FDA ayrıca COVID-19 için Antikor (Seroloji) Testi hakkında bilgi sağlar : Hastalar ve Tüketiciler için Bilgiler ve yeni ek bilgiler mevcut olduğunda sayfayı güncelleyecektir.

Raporlama Sorunları
SARS-CoV-2 antikor testiyle ilgili bir sorununuz olduğunu düşünüyorsanız FDA , sorunu MedWatch Gönüllü Raporlama Formu aracılığıyla bildirmenizi önerir .

FDA’nın kullanıcı tesisi raporlama gerekliliklerine tabi olan tesislerde istihdam edilen sağlık personeli, tesisleri tarafından belirlenen raporlama prosedürlerini izlemelidir.

SARS-CoV-2 virüsünün neden olduğu COVID-19 pandemisi, 27 Nisan 2020 itibariyle dünya genelinde 211.000’den fazla ölümle üç milyondan fazla onaylanmış vakaya yol açtı. Dünya çapında milyarlarca insanın yaşam ve çalışma koşulları, Birçok şehirde farklı sosyal mesafeler ve sokağa çıkma kısıtlamaları nedeniyle önemli ölçüde kesintiye uğradı. Dünya ekonomisi, işlerin kapanması ve seyahat üzerindeki büyük kısıtlamaların bir sonucu olarak önemli ölçüde zayıfladı. Doğru ve hızlı test prosedürlerinin yaygın olarak bulunması, SARS-CoV-2 enfeksiyonu ve bağışıklığıyla ilgili karmaşık dinamikleri çözmede son derece değerlidir. Bu amaçla, dünyanın dört bir yanındaki laboratuvarlar, üniversiteler ve şirketler kritik olarak ihtiyaç duyulan test kitlerini geliştirmek ve üretmek için yarışıyor.

COVID-19’un yayılmasını kontrol altına almanın birçok zorluğundan biri, virüsün yakın temaslılara yayılmasıyla sonuçlanan asemptomatik vakaları belirleme yeteneğidir. Erken bir COVID-19 salgını nedeniyle geçici karantinaya alınan Diamond Princess Cruise gemisindeki yolcular üzerinde yapılan bir çalışmada, asemptomatik oranın (tüm enfekte vakalar arasında) %17,9 (%95 CrI: %15.5–20.2) olduğu tahmin edildi. 1 Bu nedenle, SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş kişilerin gerçek sayısı, pozitif test sonuçlarına göre şu anda açıklanandan çok daha yüksek olabilir. 2 Yaygın dağıtım için doğru, kullanışlı ve hızlı testlere sahip olmak, asemptomatik viral taşıyıcılar tarafından COVID-19’un sessiz yayılmasının ortadan kaldırılmasına yardımcı olabilir.

COVID-19, hafif grip benzeri semptomlardan yaşamı tehdit eden durumlara kadar çeşitli klinik belirtiler gösterdiğinden, COVID-19 hastalarını diğer hastalıkları olanlardan belirlemek için enfeksiyonun erken evrelerinde etkili testlerin yapılması önemlidir. Bu, negatif bireylerin gereksiz karantinaya alınmasını ve enfeksiyonun pozitif bireyler tarafından yayılmasını önler. Erken teşhis, doktorların COVID-19 hastalığından daha ciddi komplikasyonlar geliştirme riski daha yüksek olan hastalara hızlı müdahale sağlamasına olanak tanır. Viral genomik dizilemeye dayalı daha karmaşık tanı testleri, SARS-CoV-2 ile ilişkili mutasyonel değişkenlik oranını ve derecesini belirlemek ve daha etkili aşı geliştirme için virüsün yeni ortaya çıkan suşlarını belirlemek için önemli bir araçtır. Ticari bir aşı bulunana kadar, semptomları olan veya olmayan SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş ve antiviral bağışıklık geliştirmiş kişileri belirlemek önemlidir. Bu, genel popülasyonlar arasında bağışıklığın gücü ve dayanıklılığının ek analizlerine izin verir.

Ticari olarak temin edilebilen COVID-19 testleri şu anda iki ana kategoriye ayrılmaktadır. İlk kategori, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tabanlı teknikler veya nükleik asit hibridizasyonu ile ilgili stratejiler kullanılarak SARS-CoV-2 viral RNA’nın saptanmasına yönelik moleküler tahlilleri içerir. İkinci kategori, büyük ölçüde, virüse maruz kalmanın bir sonucu olarak bireyler tarafından üretilen antikorların saptanmasına veya enfekte bireylerde antijenik proteinlerin saptanmasına dayanan serolojik ve immünolojik tahlilleri içerir. Bu iki test kategorisinin COVID-19 pandemisinin yönetiminde örtüşen amaçlara hizmet ettiğini yeniden vurgulamak önemlidir. SARS-CoV-2 viral RNA testi, enfeksiyonun akut fazı sırasında SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş kişileri tanımlar. Serolojik testler daha sonra virüse karşı antikor geliştiren ve potansiyel iyileşen plazma donörleri olabilecek bireyleri tanımlar. Aynı zamanda temas takibi yapma ve zaman içinde bireylerin ve grupların bağışıklık durumunu izleme yeteneğini de geliştirir.3

Zamanında teşhis, etkili tedavi ve gelecekte önleme, COVID-19’un yönetiminin anahtarıdır. SARS-CoV-2 enfeksiyonunun doğrulanması için uygun maliyetli temas noktası test kitleri ve verimli laboratuvar teknikleri geliştirmeye yönelik mevcut yarış, yeni bir teşhis inovasyonu sınırını ateşledi. Devam eden inovasyona yardımcı olmak için bu raporu, CRISPR dahil olmak üzere geleneksel ve yeni metodolojilere dayanan mevcut COVID-19 teşhis eğilimlerine ve stratejilerine genel bir bakış sağlamak için geliştirdik. Test kitleri ve geliştiriciler hakkında güncel bilgilerin yanı sıra CAS içerik koleksiyonlarından ve MEDLINE’dan alınan dergi yayın bilgilerine dayanan COVID-19 teşhis eğilimleri hakkındaki verileri içerir.Git:

2. Viral Nükleik Asitlerin Tespiti için Moleküler Testler

SARS-CoV-2, tek sarmallı, pozitif anlamda bir RNA virüsüdür ve tüm genetik dizisi 10 Ocak 2020’de Tüm Grip Verilerini Paylaşma Küresel Girişimi (GISAID) platformuna yüklendiğinden, şirketler ve araştırma grupları, haftalarca COVID-19 için bir dizi teşhis kiti geliştirdi. Dizi verilerinin mevcudiyeti, SARS-CoV-2’ye özgü testlerin geliştirilmesi için gerekli olan primerlerin ve probların tasarımını kolaylaştırmıştır. 4

2.1. Ters Transkripsiyon-Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR)

RT-PCR, bir numunede çok az miktarda viral genetik materyali çoğaltma yeteneğine dayanır ve SARS-CoV-2 virüsünün tanımlanmasında altın standart olarak kabul edilir. Şu anda, COVID-19 için RT-PCR testleri genellikle swablar kullanılarak üst solunum sisteminden toplanan örnekleri kullanır. Ek olarak, serum, dışkı veya oküler sekresyonlar kullanılarak da birkaç çalışma yapılmıştır. 5 − 7 Yakın zamanda, Rutgers Clinical Genomics Laboratory, diğer numune toplama yöntemlerinden daha hızlı ve daha az ağrılı olan, kendi kendine toplanan tükürük numunelerini kullanan ve sağlık hizmeti sağlayıcıları için riskleri azaltan bir RT-PCR testi (TaqPath COVID-19 Combo kiti) geliştirdi. , ve daha yüksek hacimli testleri etkinleştirebilir. 8 , 9

Resimde gösterildiği gibi Figür​Şekil 11RT-PCR, viral genomik RNA’nın RNA’ya bağımlı DNA polimeraz (ters transkriptaz) tarafından DNA’ya laboratuvarda dönüştürülmesiyle başlar. Bu reaksiyon, RNA viral genomu üzerindeki tamamlayıcı dizileri spesifik olarak tanımak üzere tasarlanmış küçük DNA dizisi primerlerine ve viral RNA’nın kısa bir tamamlayıcı DNA kopyasını (cDNA) oluşturmak için ters transkriptazına dayanır. Gerçek zamanlı RT-PCR’de, PCR reaksiyonu ilerledikçe DNA’nın amplifikasyonu gerçek zamanlı olarak izlenir. Bu, TaqMan tahlillerinde olduğu gibi, bir flüoresan boya veya bir flüoresan molekülü ve bir söndürücü molekül ile etiketlenmiş diziye özgü bir DNA probu kullanılarak yapılır. Otomatik bir sistem daha sonra, genellikle bir floresan veya elektrik sinyali ile viral cDNA tespit edilene kadar amplifikasyon işlemini yaklaşık 40 döngü boyunca tekrarlar. 10Şekil 1

Ters transkripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR). RT-PCR, viral RNA’nın belirli bir bölümünün cDNA kopyasını oluşturur ve bu, katlanarak amplifiye edilen dsDNA’ya dönüştürülür.

RT-PCR geleneksel olarak tek adımlı veya iki adımlı bir prosedür olarak gerçekleştirilmiştir. Tek adımlı gerçek zamanlı RT-PCR, tüm RT-PCR reaksiyonunu çalıştırmak için gerekli primerleri içeren tek bir tüp kullanır. İki aşamalı gerçek zamanlı RT-PCR, ayrı ters transkripsiyon ve amplifikasyon reaksiyonlarını yürütmek için birden fazla tüp içerir, ancak tek adımlı prosedürden daha fazla esneklik ve daha yüksek hassasiyet sunar. Daha az başlangıç ​​materyali gerektirir ve birden fazla hedefin nicelleştirilmesi için cDNA’nın stoklanmasına olanak tanır. 11 Tek adımlı prosedür genellikle SARS-CoV-2’nin tespiti için tercih edilen yaklaşımdır, çünkü kurulumu hızlıdır ve sınırlı numune işleme ve daha az çalışma süresi içerir, pipetleme hataları ve RT ile gerçek arasında çapraz kontaminasyon olasılığını azaltır. -zamanlı PCR adımları.

Bugüne kadar moleküler tanı testlerinin çoğu, ORF1b veya ORF8 bölgeleri ve nükleokapsid (N), spike (S) proteini, RNA dahil olmak üzere farklı SARS-CoV-2 genomik bölgelerini hedefleyen gerçek zamanlı RT-PCR teknolojisini kullanmıştır. bağımlı RNA polimeraz (RdRP) veya zarf (E) genleri (bkz . bölüm 2.5’teki Tablo 1 ve Destekleyici Bilgi Tablosu S1 ). 12 – 15

Tablo 1

SARS-CoV-2’de Viral Genetik Malzemeyi Saptamak İçin Kullanılan Moleküler Tanı Testlerine Örnekler

deneme adı test türü üretici/kuruluş adı örnek kaynak gen veya bölge tespit edildi test sonucu süresi/ek bilgi çıktı bilgisi EUA b onay ülkesi
ŞİMDİ KİMLİK COVID-19 izotermal nükleik asit amplifikasyon teknolojisi Abbott Diagnostics Scarborough, Inc. burun, nazofaringeal ve boğaz sürüntüleri RdRP geni pozitif sonuçlar <5 dakika ve negatif sonuçlar 13 dakika içinde 1 örnek/çalışma ABD FDA 27.03.2020 Amerika Birleşik Devletleri
iAMP COVID-19 tespit kiti gerçek zamanlı RT izotermal amplifikasyon testi Atila BioSystems, Inc. D11 burun, nazofaringeal ve orofaringeal sürüntüler ORF1ab ve/veya N geni sonuçlar <1.5 saat yüksek verim a ABD FDA 4/10/2020 Amerika Birleşik Devletleri
BioFire COVID-19 testi multipleks gerçek zamanlı RT-PCR BioFire Savunma, LLC nazofaringeal sürüntüler ORF1ab ve ORF8 Sonuçlar ∼45 dk 94 örnek/çalışma ABD FDA 23.03.2020 Amerika Birleşik Devletleri
CDC 2019- Novel Coronavirus Real-Time RT-PCR Tanı Paneli gerçek zamanlı RT-PCR CDC-ABD nazofaringeal veya orofaringeal aspiratlar/yıkamalar/svaplar ve bronkoalveolar lavaj sıvısı, trakeal aspiratlar, balgam N geni kontrol olarak kullanılan insan RNase P geni 264 örnek/gün ABD FDA 2/4/2020 Amerika Birleşik Devletleri
Xpert Xpress SARS-CoV-2 testi gerçek zamanlı RT-PCR Sefeid nazofaringeal, nazal ve orta turbinat swabları N2 ve E genleri <1 dakika uygulama süresi ile ∼45 dakika ile sonuçlanır yüksek verim a ABD FDA 20.03.2020 Avustralya, Kanada, Singapur, Amerika Birleşik Devletleri
SARS-CoV-2 için CRISPR tabanlı testler CRISPR tabanlı yanal akış tahlili izotermal amplifikasyonu Cepheid Sherlock Biosciences solunum örnekleri viral RNA Nükleik asit tespiti için Sherlock’un Cas12 ve Cas13 enzimlerini Cepheid’in GeneXpert test işleme cihazlarıyla birleştirir   ABD FDA 20.03.2020 Amerika Birleşik Devletleri
VitaPCR SARS-CoV-2 testi gerçek zamanlı PCR Credo Diagnostics Biyomedikal Ticaret Ltd. burun ve orofaringeal sürüntüler viral RNA 1 dakikalık uygulama süresi ile 20 dakikada sonuçlanır 2000 numune/gün CE işareti 3/2020 Singapur
LYRA SARS-CoV-2 testi gerçek zamanlı RT-PCR Teşhis Hibritleri, Inc. Quidel Corporation nazofaringeal ve orofaringeal sürüntüler pp1ab ekstraksiyondan sonra <75 dakika ile sonuçlanır   ABD FDA 17.03.2020 Kanada
SARS-CoV-2 testi gerçek zamanlı RT-PCR Teşhis Moleküler Laboratuvarı – Northwestern Medicine nazofaringeal, orofaringeal, nazal ve orta turbinat nazal swablar ve bronkoalveolar lavaj sıvısı N1 ve RdRP genleri manuel RNA ekstraksiyonu olmadan <1 saat ile sonuçlanır   ABD FDA 4/2/2020 Amerika Birleşik Devletleri
Simplexa COVID-19 Doğrudan gerçek zamanlı RT-PCR DiaSorin Moleküler LLC nazofaringeal sürüntüler OFR1ab ve S geni RNA ekstraksiyonu olmadan ∼1 saat ile sonuçlanır yüksek verim a ABD FDA 19.03.2020 Amerika Birleşik Devletleri
ePlex SARS-CoV-2 testi RT-PCR GenMark Teşhis A.Ş. nazofaringeal sürüntüler RNA <2 dakika uygulamalı çalışma süresi ve ∼2 saat ile sonuçlanır   ABD FDA 19.03.2020 Amerika Birleşik Devletleri
Panther Fusion SARS-CoV-2 testi (Panther Fusion System) gerçek zamanlı RT-PCR Holojik A.Ş. nazofaringeal ve orofaringeal sürüntüler ORF1ab bölgeleri 1 ve 2 each Panther Fusion system can provide results in <3 h and process up to 1150 coronavirus tests in 24-h period 1 sample/run Australia 3/20/2020, US FDA 3/16/2020 Australia, United States
COVID-19 RT-PCR test real-time RT-PCR LabCorp Laboratory Corporation of America nasopharyngeal and oropharyngeal swabs/washes/aspirates and sputum, bronchoalveolar lavage fluid N gene results in 2–4 days 24 samples/run US FDA 3/16/2020 United States
ARIES SARS-CoV-2 assay real-time RT-PCR Luminex Corporation nasopharyngeal swabs ORF1ab and N gene minimal hands-on time and an automated workflow delivers results in ∼2 h high throughputa US FDA 4/3/2020 United States
SARS-CoV-2 DETECTR CRISPR-based lateral flow assay isothermal amplification Mammoth Biosciences respiratory samples E and N genes CRISPR Cas12a-based lateral flow assay results in 30–40 min high throughputa filed for US FDA 4/16/2020 United States
Accula SARS-CoV-2 test PCR and lateral flow technologies Mesa Biotech Inc. throat and nasal swabs N gene results in 30 min, the palm-sized device can be used in physician office or patients’ home 144 tests/day US FDA 3/23/2020 United States
MiRXES FORTITUDE KIT 2.0 real-time RT-PCR MiRXES Pte Ltd. nasopharyngeal swabs viral RNA genes less prone to mutation results in 90 min, produces 100,000 test kits/wk 96 samples in 1 run Singapore HSA 3/2020 Singapore
QIAstat-Dx Respiratory SARS-CoV-2 panel multiplex real-time RT-PCR Qiagen GmbH nasopharyngeal swabs E and RdRP genes results in ∼1 h, by differentiating novel coronavirus from 21 other bacterial and viral respiratory pathogens 1 sample/run US FDA 3/30/2020 United States
cobas SARS-CoV-2 real-time RT-PCR Roche Molecular Systems, Inc. nasopharyngeal and oropharyngeal swabs viral RNA results in ∼3.5 h, instruments can process up to 384 results (cobas 6800 System) and 1056 results (cobas 8800 System) in 8 h high throughputa Australia 2/20/20, CE mark 2020, US FDA 3/12/20 Australia, Brazil, Canada, Japan, Singapore, United States
TaqPath COVID-19 combo kit multiplex real-time RT-PCR Rutgers Clinical Genomics Laboratory ThermoFisher-Applied Biosystems oropharyngeal, nasopharyngeal, anterior nasal, midturbinate nasal swabs and saliva specimens ORF1b and N and S genes   high throughputa US FDA 3/13/2020 United States
Novel Coronavirus (2019-nCoV) Nucleic Acid diagnostic kit (PCR-fluorescence probing) real-time RT-PCR Sansure Biotech Inc. nasopharyngeal and oropharyngeal swab, serum, blood and feces ORF1ab and N gene results in 30 min   China NMPA 4/2020 China
STANDARD M nCoV RT detection kit real-Time RT-PCR SD BIOSENSOR oropharyngeal swabs E ve RdRP genleri 90 dakika içinde sonuçlar   Kore MFDS 27.02.2020 Güney Kore
Allplex 2019-nCoV tahlili multipleks gerçek zamanlı RT-PCR Seegene nazofaringeal, orofaringeal veya ön nazal sürüntüler, orta turbinat ve balgam örnekleri E, N ve RdRP genleri ekstraksiyondan <2 saat sonra sonuçlanır   CE işareti 2/2020, Kore MFDS 2/12/2020, US FDA 21/04/2020 Avustralya, Güney Kore, Singapur, Amerika Birleşik Devletleri
Viracor SARS-CoV-2 testi gerçek zamanlı RT-PCR Viracor Eurofins Klinik Teşhis nazofaringeal, nazal, orofaringeal yıkama/svaplar ve bronkoalveolar lavaj sıvısı N geni aynı gün, numunenin alınmasından 12-18 saat sonra sonuçlar   ABD FDA 4/6/2020 Amerika Birleşik Devletleri

Ayrı bir pencerede aça FDA bilgileri https://www.fda.gov/media/136702/download .b ABD FDA veya diğer ilaç düzenleme makamları tarafından Acil Kullanım İzni.

Olay yerine gelecek en erken COVID-19 RT-PCR tanı testleri arasında (1) COVID-19 RT-PCR (LabCorp), 16 (2) 2019-Novel Coronavirus Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel [ABD Hastalık Merkezleri] yer aldı. Control and Prevention (CDC)], 17 (3) TaqPath COVID-19 Combo kit (ThermoFisher-Applied Biosystems), 18 (4) Allplex 2019-nCoV Assay (Seegene), 19 ve (5) cobas SARS-CoV-2 ( Roche). 20 Bu testler ile ilgili ayrıntılı bilgiler sağlanmıştır Tablo 1 de bölüm 2.5 ve bilgi I desteklenmesi .

RT-PCR testleri, gelişmiş algılama yöntemleri ve daha otomatikleştirilmiş prosedürlerle sürekli olarak gelişmektedir. Örneğin, GenMark Diagnostics, Inc. 21 tarafından geliştirilen ePlex SARS-CoV-2 testi , nazofaringeal sürüntülerde SARS-CoV-2’yi tespit etmek için “Gerçek Örnekten Yanıta Çözüm” ePlex cihazını kullanır. Her test kartuşu, viral RNA’nın manyetik katı faz ekstraksiyonu, cDNA amplifikasyonu ve elektroıslatma ile GenMark’ın eSensor teknolojisini birleştiren saptama için reaktifler içerir. Hedef DNA, belirli hedeflere tamamlayıcı olan ferrosen etiketli sinyal probları ile karıştırılır. Hedef DNA, sinyale hibritleşir ve her ikisi de altın kaplama elektrotlara bağlı olan probları yakalar. Bir hedefin varlığı, ferrosen etiketli sinyal probundan spesifik elektrik sinyalleri üreten voltametri kullanılarak belirlenir.

RT-PCR, SARS-CoV-2 enfeksiyonlarını saptamak için en yaygın olarak kullanılan yöntem olmasına rağmen, pahalı laboratuvar enstrümantasyonu, yüksek vasıflı laboratuvar personeli gerektirme dezavantajına sahiptir ve sonuç üretmesi günler alabilir. Sonuç olarak, dünya çapında bir dizi şirket ve laboratuvar, RT-PCR teknolojilerinin verimliliğini ve güncelliğini daha da iyileştirmek ve çeşitli başka teknikler geliştirmek için çalışıyor.

2.2. İzotermal Nükleik Asit Amplifikasyonu

RT-PCR, her döngü için karmaşık termal döngü ekipmanlarını içeren birden fazla sıcaklık değişikliği gerektirir. 22 İzotermal nükleik asit amplifikasyonu, sabit bir sıcaklıkta amplifikasyona izin veren ve bir termal döngüleyici ihtiyacını ortadan kaldıran alternatif bir stratejidir. Bu nedenle, bu prensibe dayalı çeşitli yöntemler geliştirilmiştir.

2.2.1. Ters Transkripsiyon Döngüsü Aracılı İzotermal Amplifikasyon (RT-LAMP)

RT-LAMP, SARS-CoV-2 için hızlı ve uygun maliyetli bir test alternatifi olarak geliştirilmiştir. Da gösterildiği gibiFigür​Şekil 22RT-LAMP, duyarlılığı arttırmak için hedef gen/bölgeye özgü dört primer seti gerektirir ve RNA’nın saptanmasına izin vermek için LAMP’yi bir ters transkripsiyon adımıyla birleştirir. Amplifikasyon ürünü, amplifikasyonun bir yan ürünü olarak solüsyondaki magnezyum pirofosfat çökeltisinin neden olduğu bulanıklık ölçülerek fotometri yoluyla saptanabilir. Reaksiyon, bulanıklık ölçülerek veya ara boyalar kullanılarak floresan ile gerçek zamanlı olarak takip edilebilir. Gerçek zamanlı RT-LAMP tanı testi yalnızca ısıtma ve görsel inceleme gerektirdiğinden, basitliği ve hassasiyeti, onu virüs tespiti için umut verici bir aday haline getirir. 23

Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı oc0c00501_0002.jpg

Ayrı bir pencerede açşekil 2

Ters transkripsiyon döngüsü aracılı izotermal amplifikasyon (RT-LAMP). Adım 1: Viral RNA’nın 3′-ucunda, ters transkriptaz ve BIP primeri, RNA’nın cDNA’ya dönüşümünü başlatır. Adım 2: Aynı uçta, DNA polimeraz ve B3 primeri, birinci cDNA zincirini yerinden çıkarmak ve serbest bırakmak için ikinci cDNA zincirini oluşturmaya devam eder. Adım 3: FIP primeri, salınan cDNA zincirine bağlanır ve DNA polimeraz tamamlayıcı zinciri oluşturur. Adım 4: F3 primeri 3′ ucuna bağlanır ve DNA polimeraz daha sonra eski ipliği değiştirirken yeni bir iplik oluşturur. LAMP döngüsü, bir DNA indikatör boyası tarafından tespit edildiği gibi, hedef dizinin dönüşümlü olarak ters çevrilmiş tekrarlarını içeren çeşitli büyüklükte çift sarmallı ilmekli DNA yapıları üretir. Reaktifler*: Ters transkriptaz içeren primerler ve ana karışım, iplik değiştirme aktivitesine sahip DNA polimeraz, dNTP’ler,

‘De gösterildiği gibi , Tablo 1 de bölüm 2.5 , tespit etmek için, şu anda mevcut moleküler deneylerin birkaç SARS CoV-2 (bakınız örneğin Abbott Diagnostics İD GEÇ COVID-19 testi olarak, gerçek zamanlı RT-LAMBA teknolojisini kullanarak bilgi I Destekleyici detaylar için). Bu bakım noktası testi hızlıdır (13 dakika veya daha az) ve üst solunum sürüntülerinde SARS-CoV-2 viral RNA’sını saptamak için kullanılır, ancak çalışma başına bir örnekle sınırlıdır. 24 , 25

Zhang ve diğerleri tarafından hazırlanan RT-LAMP testi. viral RNA’yı cDNA’ya dönüştürmek için ters transkriptaz (BioLabs’tan WarStart RTx) kullanır, bu daha sonra bir DNA bağlayıcı boya (SYTO-9, ThermoFisher) ile hızlı kolorimetrik algılama için DNA’ya bağlı DNA polimeraz (Bst2.0 Warmstart) tarafından amplifiye edilir S34854 ). 26 Enzim, 40 °C’nin altında RTx aktivitesini inhibe eden, tersine çevrilebilir şekilde bağlı bir aptamer ile birleştirilmiş, siliko tasarımlı benzersiz bir RNA-yönelimli DNA polimerazdır. LAMP’de kullanım için özellikle uygundur. Kolorimetrik LAMP’nin, SARS-CoV-2 RNA’nın hızlı ve basit tespiti için RT-PCR’ye bir alternatif sağlayarak, parazit olmadan yaklaşık 480 RNA kopyası seviyelerinde hücre lizatlarındaki viral RNA’yı tespit etmede etkili olduğu gösterilmiştir.

2.2.2. Transkripsiyon Aracılı Amplifikasyon (TMA)

TMA, RT-PCR’den çok daha verimli bir şekilde RNA veya DNA’nın belirli bölgelerini amplifiye etmek için kullanılabilen, retroviral replikasyondan sonra modellenen patentli tek tüplü izotermal amplifikasyon teknolojisidir. 27 Bir retroviral ters transkriptaz ve T7 RNA polimeraz kullanır ve çoklu patojenlerden nükleik asitlerin saptanması için kullanılmıştır. Bu ilke temelinde, Hologic’in Panther Fusion platformu hem RT-PCR hem de TMA gerçekleştirme yeteneğine sahiptir. 28 Panther füzyon platformu, yüksek test verimi (24 saatte 1000 teste kadar) ve aynı hasta numunesi ve toplama şişesi kullanılarak semptomları COVID-19 ile örtüşen diğer yaygın solunum yolu virüslerini eş zamanlı olarak tarama kapasitesi nedeniyle farklıdır.

İlk adım, viral RNA hedefinin spesifik bir yakalama sondasına ve bir manyetik alan uygulanarak manyetik mikropartiküller üzerinde yakalanan bir T7 promotör primeri içeren ek bir oligonükleotide hibridizasyonunu içerir. Ardından, T7 promotör primerine hibritlenen yakalanan RNA hedefi, tamamlayıcı bir cDNA’ya ters kopyalanır. Ters transkriptazın RNaz H aktivitesi daha sonra hedef RNA zincirini hibrit RNA-cDNA dupleksinden bozar ve T7 promotörünü içeren tek iplikli bir cDNA bırakır. Daha sonra T7 RNA polimeraz tarafından RNA amplikonlarına kopyalanan çift sarmallı bir DNA oluşturmak için ek bir primer kullanılır. Bu yeni RNA amplikonları daha sonra TMA prosesine yeniden girerek bu üstel amplifikasyon prosesinin 1 saatten daha kısa bir sürede milyarlarca RNA amplikonunu üretmesini sağlar. Tespit işlemi, gerçek zamanlı olarak spesifik olarak RNA amplikonuna hibridize olan tek sarmallı nükleik asit torçlarının kullanımını içerir. Her torç, bir florofor ve bir söndürücüye konjuge edilmiştir. Torç, RNA amplikonuna hibritleştiğinde, florofor, uyarma üzerine bir sinyal yayabilir.

2.2.3. CRISPR Tabanlı Testler

Kümelenmiş Düzenli Aralıklı Kısa Palindromik Tekrarlar (CRISPR), bakteriler gibi prokaryotik organizmalarda bulunan bir nükleik asit dizileri ailesini temsil eder. Bu diziler, Cas9, Cas12 ve Cas13 ile örneklenen, CRISPR ile ilişkili enzimler adı verilen bir dizi bakteriyel enzim tarafından tanınabilir ve kesilebilir. Cas12 ve Cas13 ailelerindeki belirli enzimler, viral RNA dizilerini hedeflemek ve kesmek için programlanabilir. 29

CRISPR öncü bilim adamları tarafından kurulan iki şirket, Mammoth Biosciences ve Sherlock Biosciences, bağımsız olarak SARS-CoV-2’nin tespiti için gen düzenleme CRISPR metodolojisini kullanma olasılığını araştırıyor. Sherlock Biosciences tarafından geliştirilen SHERLOCK yöntemi, SARS-CoV-2’ye özgü kılavuz RNA tarafından aktivasyona yanıt olarak raportör RNA dizilerini kesebilen Cas13’ü kullanır. 30 Mammoth Biosciences’ın DETECTR tahlili, E ve N genlerinin viral RNA dizilerini spesifik olarak saptamak için haberci RNA’nın Cas12a tarafından bölünmesine, ardından hedefin izotermal amplifikasyonuna ve bunun bir florofor ile görsel bir okuma ile sonuçlanmasına dayanır. 31 Bu CRISPR tabanlı yöntemler, aşağıda gösterildiği gibiFigür​Figür 33, karmaşık enstrümantasyon gerektirmez ve duyarlılık veya özgüllük kaybı olmadan SARS-CoV-2 virüsünün varlığını tespit etmek için kağıt şeritler kullanılarak okunabilir. Bu testler hem düşük maliyetlidir hem de 1 saat gibi kısa bir sürede gerçekleştirilebilir. Bu testler, bakım noktası teşhisi için büyük potansiyele sahiptir. 4 , 32 , 33Figür 3

Viral RNA’yı saptamak için iki alternatif CRISPR yöntemi. Yöntem A (SHERLOCK tahlili 30 ): RT-RPA (rekombinaz polimeraz amplifikasyonu) viral RNA’yı dsDNA’ya dönüştürür. T7 transkripsiyonu, dsDNA şablonundan tamamlayıcı RNA üretir. Cas13–tracrRNA kompleksi, hedef diziyi ve floresan RNA raportörünü parçalamak için Cas13’ün genel nükleaz enzim aktivitesini aktive eden hedef diziye bağlanır. Yöntem B (DETECTR tahlili 31 ): RT-RPA (rekombinaz polimeraz amplifikasyonu) viral RNA’yı dsDNA’ya dönüştürür. Cas12a–tracrRNA kompleksi, hedef diziyi ve floresan RNA raportörünü parçalamak için Cas12a’nın genel nükleaz enzim aktivitesini aktive eden hedef diziye bağlanır.

2.2.4. Yuvarlanan Daire Amplifikasyonu

Çember amplifikasyonu (RCA), haddeleme gibi bilinen izotermal nükleik asit amplifikasyonu için alternatif bir yöntem, izotermal şartlarda, çünkü 10 edebilen, nükleik asit saptama için büyük ilgi çekmiştir 9 , 90 dakika içinde her çemberin kat sinyal amplifikasyonu. RCA, minimum reaktiflerle izotermal koşullar altında gerçekleştirilebilmesi ve PCR tabanlı deneylerde sıklıkla karşılaşılan yanlış pozitif sonuçların oluşmasını önlemesi bakımından avantajlıdır. SARS-CoV’nin RCA tarafından saptanması için etkili bir tahlil, daha önce hem sıvı hem de katı fazlarda gerçekleştirildi ve klinik solunum örneklerini test etmek için kullanıldı. 34 Ancak bu yöntem, bu noktada SARS-CoV-2’nin tespiti için kullanılmamıştır.

2.3. Mikroarray Kullanarak Nükleik Asit Hibridizasyonu

SARS-CoV nükleik asitlerinin hızlı yüksek verimli tespiti için mikroarray tahlilleri kullanılmıştır. Da gösterildiği gibiFigür​Şekil 44, ters transkripsiyon ve ardından cDNA’nın spesifik problarla etiketlenmesi kullanılarak viral RNA’dan cDNA üretilmesine dayanırlar. Etiketli cDNA’lar, yüzeylerine sabitlenmiş katı fazlı oligonükleotitleri içeren mikrodizi tepsilerinin oyuklarına yüklenir. Hibritleşirlerse, bağlanmamış DNA’yı yıkadıktan sonra bağlı kalacaklar, böylece virüse özgü nükleik asidin varlığına işaret edecekler. 35 Mikroarray testinin SARS-CoV ile ilişkili mutasyonları belirlemede yararlı olduğu kanıtlanmıştır ve SARS-CoV’nin spike (S) genindeki mutasyonlarla ilişkili 24’e kadar tek nükleotid polimorfizmini (SNP) %100 doğrulukla saptamak için kullanılmıştır. 36

Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı oc0c00501_0004.jpg

Ayrı bir pencerede açŞekil 4

Mikrodizi kullanarak nükleik asit hibridizasyonu. Viral cDNA ve farklı floresan etiketlere sahip referans cDNA karıştırılır ve spesifik DNA probları ile kaplanmış mikrodizi kuyularına uygulanır.

COVID-19 pandemisi geliştikçe, ortaya çıkan farklı SARS-CoV-2 suşlarını tespit etme yeteneği gerekli hale gelebilir ve mikroarray tahlilleri, mutasyonel varyasyonun bir sonucu olarak bu suşların hızlı tespiti için bir platform sağlar. Mikrodizi testinin dezavantajlarından biri, genellikle onunla ilişkili yüksek maliyet olmasına rağmen, tek tek gerçek zamanlınınkine eşit bir duyarlılığa sahip birden fazla koronavirüs suşunu tespit etmek için floresan olmayan, düşük maliyetli, düşük yoğunluklu bir oligonükleotit dizisi testi geliştirilmiştir. RT-PCR. 37 Ek olarak, MERS koronavirüsüne ve ayrıca influenza ve respiratuar sinsityal virüslere özgü nükleik asitleri tanımlamak için mikroarray çipine dayalı taşınabilir bir tanı platformu kullanılmıştır. 38

2.4. Amplikon Tabanlı Metagenomik Dizileme

SARS-CoV-2’nin tanımlanmasına yönelik bu tanı tekniği, metagenomik sıralamaya ek olarak amplikon tabanlı sıralamanın kullanımını içeren ikili bir yaklaşıma dayanır. Metagenomik dizileme, öncelikle enfekte bireylerin arka plan mikrobiyomunu ele almak için kullanılır. Hem SARS-CoV-2 virüsünü hem de COVID-19 semptomlarının şiddetini etkileyen ikincil enfeksiyonlara katkıda bulunan diğer patojenleri hızlı bir şekilde tanımlama yeteneği sağlar. SARS-CoV-2’nin amplikon tabanlı dizilimi, potansiyel temas takibine, moleküler epidemiyolojiye ve viral evrim çalışmalarına izin verir. Diziden bağımsız tek primer amplifikasyonu (SISPA) gibi metagenomik yaklaşımlar, dizi farklılığı üzerinde ek kontroller sağlar.

Amplikon ve metagenomik MinION tabanlı dizileme Moore ve ark. (2020), ISARIC 4C konsorsiyumu tarafından COVID-19’lu hastalardan elde edilen nazofaringeal sürüntülerdeki SARS-CoV-2 genomunu ve diğer mikrobiyomu hızla (8 saat içinde) sıralamak için. 39 Amplikon bazlı sistem için grup, yaklaşık 200 bp örtüşen bölge ile kabaca 1000 bp fragmanları sırayla büyütmek için SARS-CoV-2 genomundaki korunmuş bölgelerden 16 primer bağlama bölgesi seçti. Bu primer setleri daha sonra cDNA’dan 30 amplikon üretmek için kullanıldı ve bunlar daha sonra MinION kullanılarak dizildi.

Illumina tarafından yalnızca birden fazla koronavirüs suşunun varlığını tespit etmekle kalmayıp, aynı zamanda karmaşık bir numunede bulunan birden fazla patojenik organizmayı kapsamlı bir şekilde inceleme yeteneğine sahip yeni nesil bir av tüfeği metagenomik sıralama platformu geliştirilmiştir. Illumina metagenomik iş akışı, TruSeq Ribo-Zero Gold rRNA tükenme kiti kullanılarak numune hazırlamayı, TruSeq sarmal toplam RNA kullanılarak kitaplık hazırlamayı, Illumina masaüstü sıralama sistemini kullanarak sıralamayı ve LRM Yeniden Sıralama modülü veya IDbyDNA Explify Platformu kullanılarak son veri analizini içerir. 40

2.5. SARS-CoV-2 Tespiti Üzerine Güncel Moleküler Genetik Testlere Yüksek Düzeyde Genel Bakış

Bilimsel literatür, yıllar boyunca viral nükleik asitleri tespit etmek için kullanılan birçok farklı moleküler genetik tahlili sıralamış olsa da, SARS-CoV-2 virüsünü tespit etmek için geliştirilen en son tahliller RT-PCR ve izotermal nükleik asit amplifikasyon teknolojilerine dayanmaktadır. COVID-19 teşhisi için tahlillere acil ihtiyaç duyulması nedeniyle, üreticiler, ticari laboratuvarlar ve moleküler temelli laboratuvarlar, testleri için EUA’yı teşhis amacıyla FDA’dan veya diğer düzenleyici kurumlardan talep edebilir. FDA tarafından acil kullanım için onaylanan yeni testler analitik geçerliliğe dayanmaktadır ve kanıtlanmış klinik geçerlilik şartı olmaksızın doğrulanmış pozitif numuneler ve negatif kontroller kullanılarak idealleştirilmiş koşullar altında geliştirilmiştir. 41Üreticilerden ve ticari laboratuvarlardan alınan testler için EUA onayı, 1988 Klinik Laboratuvar İyileştirme Değişiklikleri (CLIA) kapsamında sertifikalandırılmış klinik laboratuvarlarda yapılacak testleri sınırlar. Öte yandan, moleküler tabanlı laboratuvarlardan (laboratuvar tarafından geliştirilen testler) yapılan testlerin EUA onayı, testi geliştiren ve CLIA kapsamında sertifikalandırılmış tek laboratuvarda yapılacak testleri sınırlar.

SARS-CoV-2’yi saptamak için mevcut 112 moleküler tahlilden ( Destekleyici Bilgi Tablosu S1’de ayrıntılı olarak verilmiştir ), %90’ı PCR veya RT-PCR teknolojilerini kullanır, %6’sı izotermal amplifikasyon teknolojilerini kullanır, %2’si hibridizasyon teknolojilerini kullanır ve %2’si CRISPR kullanır tabanlı teknolojiler. Bu testlerden bazıları, yüksek verimli platformlar kullanır veya sonuçlara kısa sürede ulaşır ve bu nedenle yüksek talep görür. Tablo 1 , moleküler genetik tahlilleri kullanan 20’den fazla tanısal teste genel bir bakış sağlar ve test tipi, geliştirici/üretici, verim, sonuçlara ulaşma süresi ve diğer ilgili özellikler hakkında bilgiler içerir. Daha fazla moleküler genetik tahlile dayalı testler, Destekleyici Bilgi Tablosu S1’de listelenmiştir .Git:

3. Serolojik ve İmmünolojik Testler

RT-PCR tabanlı viral RNA tespiti, COVID-19 tanısında yaygın olarak kullanılırken, hastalık evrelerinin ilerlemesini izlemek için kullanılamaz ve geçmiş enfeksiyon ve bağışıklığın geniş bir şekilde tanımlanması için uygulanamaz.

Serolojik test, kan serumu veya plazma analizi olarak tanımlanır ve tükürük, balgam ve diğer biyolojik sıvıların immünoglobulin M (IgM) ve immünoglobulin G (IgG) antikorlarının mevcudiyeti için test edilmesini içerecek şekilde operasyonel olarak genişletilmiştir. Bu test, hem kısa vadeli (günlerden haftalara) hem de uzun vadeli (yıllar veya kalıcılık) antikor yanıtı yörüngelerinin yanı sıra antikor bolluğu ve çeşitliliğinin bir değerlendirmesini sağlayarak epidemiyoloji ve aşı geliştirmede önemli bir rol oynar. IgM önce serumda birkaç gün sonra saptanabilir hale gelir ve enfeksiyondan sonra birkaç hafta sürer ve ardından IgG’ye geçiş yapılır. Bu nedenle, IgM erken evre enfeksiyonun bir göstergesi olabilir ve IgG mevcut veya önceki enfeksiyonun bir göstergesi olabilir. IgG, enfeksiyon sonrası bağışıklığın varlığını önermek için de kullanılabilir. Son yıllarda, immünolojik tahlillerin karmaşıklığı ve duyarlılığı, yalnızca antikorların kendilerinin saptanması için değil, aynı zamanda antikorların (öncelikle monoklonal antikorlar) patojen türevli antijenlerin saptanması için uygulanması için de artmıştır. Bu testlerin COVID-19 epidemiyolojisi için büyük bir potansiyeli var.32 , 42 – 45ancak test sonuçları en az üç durumdan etkilenebilir: (1) SARS-CoV-2 enfeksiyonu için moleküler genetik testlerden pozitif sonuç alan bir denek alt grubu, enfeksiyonu takiben antikor üretimindeki gecikme nedeniyle seronegatiftir, (2) denekler, daha erken, daha hafif bir enfeksiyonun temizlenmesini ve (3) testlerin duyarlılık ve özgüllüğünde sınırlamayı yansıtan moleküler genetik test sonuçları için seropozitif ancak negatif olabilir. Son konu özellikle önemlidir, çünkü düşük özgüllük (çapraz reaksiyon) nedeniyle yanlış pozitif sonuçların küçük bir yüzdesi bile belirli bir popülasyonda yanıltıcı prediktif antikor prevalansına yol açabilir, bu da sosyoekonomik kararlar ve genel kamu güveni üzerinde istenmeyen etkilere neden olabilir. Sonuçlar. 46 , 47

SARS-CoV-2 maruziyetinin belirlenmesi, büyük ölçüde, spike glikoprotein (S1 ve S2 alt birimleri, reseptör bağlama alanı) ve nükleokapsid protein dahil olmak üzere çeşitli viral antijenlere özgü IgM veya IgG antikorlarının saptanmasına dayanır. . Bu belirlemeler için metodoloji, geleneksel enzime bağlı immünosorbent testini (ELISA), immünokromatografik yanal akış testini, nötralizasyon biyoanalizini ve spesifik kemosensörleri içerir. Bu formatların her biri avantajlar (hız, çoğullama, otomasyon) ve dezavantajlar (eğitimli personel, özel laboratuvarlar) getirir. Bu antikor saptama yöntemlerinin tamamlayıcısı, serolojik örneklerde viral antijen(ler)in varlığını saptamak için antikorların kullanıldığı hızlı antijen testleridir.45 FDA, Cellex Inc. tarafından üretilen ilk seroloji testi olan qSARS-CoV-2 IgG/IgM Hızlı Testi’ne 1 Nisan 2020, 48’de EUA statüsü verdi,ancak klinik laboratuvarların ve ticari üreticilerin bir EUA.

3.1. Enzim Bağlantılı İmmünosorbent Testi (ELISA)

ELISA, peptitler, proteinler, antikorlar ve hormonlar gibi maddeleri tespit etmek ve ölçmek için tasarlanmış, mikro kuyucuklu, plaka tabanlı bir tahlil tekniğidir. Test nitel veya nicel olabilir ve sonuçlara ulaşma süresi tipik olarak 1-5 saattir. SARS-CoV-2 durumunda gösterildiği gibiFigür​Şekil55A, plaka kuyuları tipik olarak bir viral protein ile kaplanır. Varsa, hasta numunelerindeki antiviral antikorlar spesifik olarak bağlanır ve bağlı antikor-protein kompleksi, kolorimetrik veya floresan bazlı bir okuma üretmek için ek bir izleyici antikorla tespit edilebilir. ELISA hızlıdır, birden fazla numuneyi test etme yeteneğine sahiptir ve artan verim için otomasyona uyarlanabilir ancak hassasiyet açısından değişken olabilir ve bakım noktası belirlemeleri için uygundur.Şekil 5

ELISA testleri, antikorları (A) veya antijenleri (B) tespit eder.

3.2. Yanal Akış İmmünoassay

Bu test tipik olarak küçük, taşınabilir ve bakım noktasında kullanılan kalitatif (pozitif veya negatif) bir kromatografik testtir. Test, sonuç 10-30 dakika içinde alınabildiği için bir tür hızlı tanı testidir (RDT). Pratikte, sıvı numuneleri, numunenin hareketsizleştirilmiş viral antijenin bir bandını geçmesine izin veren bir substrat malzemesine uygulanır. Varsa, anti-CoV antikorları bantta toplanır, burada birlikte toplanan izleyici antikorlarla birlikte sonuçları belirtmek için bir renk gelişir.Figür​Şekil66. Test ucuzdur ve eğitimli personel gerektirmez, ancak yalnızca kalitatif sonuçlar sağlar. Semptomoloji ile birlikte kullanıldığında, enfeksiyon teşhisi mümkün olabilir. Hareketsizleştirilmiş viral antijen yerine anti-CoV antikorlarının kullanıldığı hızlı antijen testleri ( bölüm 3.6 ), devam eden enfeksiyonun daha doğrudan değerlendirilmesine olanak tanır.Şekil 6

Anti-SARS-CoV-2 antikorlarının tespiti için yanal akış immünolojik testi. Numuneler, nitroselüloz membran üzerindeki kılcal akış yoluyla hareket eder. Anti-SARS-CoV-2 antikorları mevcut olduğunda, etiketli antijene bağlanırlar ve hareketsizleştirilmiş anti-insan antikorları tarafından yakalanana kadar hareket etmeye devam ederler. Yakalanan antikor-antijen kompleksinin varlığı, renkli bir test bandı olarak görselleştirilir. Etiketli kontrol antikorları, kontrol bandında yakalanana kadar göç eder.

3.3. Nötralizasyon Deneyi

Nötralizasyon deneyleri, bir antikorun kültürlenmiş hücrelerin virüs enfeksiyonunu ve viral replikasyonun sonuçta ortaya çıkan sitopatik etkilerini inhibe etme yeteneğini belirler. Bu tahlil için hastadan tam kan, serum veya plazma numuneleri seyreltilir ve hücre kültürlerine azalan konsantrasyonlarda eklenir. Nötralize edici antikorlar mevcutsa, seviyeleri, enfekte hücre kültürlerinde viral replikasyonu önleyebildikleri eşik belirlenerek ölçülebilir. Nötralizasyon testleri için sonuç alma süresi tipik olarak 3-5 gündür, ancak son gelişmeler bu süreyi saatlere indirmiştir. 49 , 50Bu tür testler, hücre kültürü tesisleri ve SARS koronavirüsü durumunda Biyogüvenlik Düzeyi 3 (BSL3) laboratuvarları gerektirir. Bu sınırlamalara rağmen, nötralize edici antikorların belirlenmesi, kısa vadede nekahat plazmasının terapötik uygulaması için ve uzun vadede aşı geliştirme için önemlidir.

3.4. Lüminesan İmmünoassay

Lüminesan immünolojik testler, antikor bazlı reaktifler için saptama sınırlarını düşüren yöntemler içerir. Genellikle kemilüminesans ve floresan içerirler. Cai et al. COVID-19 teşhisi için peptit bazlı bir manyetik kemilüminesans enzim immün testi geliştirdi ve Diazyme Laboratories, Inc. (San Diego, California), SARS-CoV-2 için iki yeni tam otomatik serolojik testin mevcut olduğunu duyurdu. tam otomatik Diazyme DZ-lite 3000 Plus kemilüminesans analizörü. 51 , 52

3.5. Biyosensör Testi

Biyosensör testleri, biyomoleküllerin spesifik etkileşimini optik, elektrik, enzimatik ve diğer yöntemlerle ölçülebilir bir okumaya dönüştürmeye dayanır. Yüzey plazmon rezonansı (SPR), antikor veya antijenin adsorpsiyonu gibi yerel rahatsızlıklar nedeniyle katı bir sınırda gelen ışıkla etkileşimi ölçen bir tekniktir. Altın bir substrat üzerine sabitlenmiş koronaviral yüzey antijeni (SCVme) kullanılarak SARS teşhisi için SPR tabanlı bir biyosensör geliştirildi. 53SPR çipi, 10 dakika içinde anti-SCVme antikorları için 200 ng/mL’lik bir alt saptama sınırına sahipti. Yakın zamanda PathSensors Inc., yeni SARS koronavirüsünü tespit etmek için bir CANARY biyosensörünü duyurdu. Bu platform, 3-5 dakika içinde bir sonuç sağlamak için virüsün yakalanmasını sinyal amplifikasyonu ile birleştiren hücre bazlı bir immünosensör kullanır. Biyosensörün Mayıs 2020’de araştırma amaçlı kullanıma sunulması planlanıyor. 54

3.6. Hızlı Antijen Testi

Moleküler genetik tahlillerin tamamlayıcısı, viral antijenlerin saptanmasına olanak sağlayan hızlı antijen testleridir. 55 , 56 Gösterildiği gibiFigür​Şekil55B, bu testler, analitik bir numuneden viral antijenlerin yakalanması için bir mekanizma sağlamak için spesifik monoklonal antikorlara dayanır. Bu testler belirli bir formatla sınırlı değildir. Örnekler arasında 2004’te SARS-CoV için bir kolorimetrik enzim immün testi, 57 , 2005’te SARS-CoV için geliştirilmiş bir kemilüminesan immün testi, 58 ve daha yakın zamanda SARS-CoV-2 nükleokapsid proteininin tespiti için bir floresan yanal akış testi 59 yer alır .

3.7. COVID-19 Teşhisi için Güncel Serolojik ve İmmünolojik Testlere Üst Düzey Genel Bakış

Tablo 2 , COVID-19 teşhisi için mevcut mevcut serolojik ve immünolojik testlerin bir koleksiyonunu sağlar ve benzer testlerin tam listesi Destekleyici Bilgiler Tablo S2’de sağlanır . 12 – 15Son olarak, serolojik ve immünolojik testler SARS-CoV-2 virüsünü izlemek için büyük bir potansiyele sahip olsa da, bu testlerin çoğu hala geliştirme aşamasındadır. Serolojik testler, sağlık çalışanları için enfeksiyon durumunu (moleküler genetik tahlillerle birlikte), seroprevalansı ve bağışıklık koruma durumunu belirlemek için sınırlı ölçüde kullanılmıştır. Bu test, antikor üretimindeki gecikme nedeniyle SARS-CoV-2 enfeksiyonları için moleküler genetik tahlil sonuçları pozitif olan hastaların yalnızca bir alt kümesinin seropozitif olması gerçeğinden etkilenir. Şu anda, seropozitifliği immün koruma ile ilişkilendiren net veya güçlü bir kanıt yoktur.

Tablo 2

SARS-CoV-2 Virüsüne Karşı Viral Protein veya Antikorları Saptamak İçin Kullanılan Serolojik ve İmmünolojik Test Örnekleri

deneme adı test türü üretici/kuruluş adı örnek kaynak Ig veya protein tespit edildi test sonucu süresi/ek bilgi EUA bir onay ülkesi
m2000 SARS-CoV-2 testi kemilüminesan mikropartikül immunoassay Abbott Çekirdek Laboratuvarı serum/plazma/tam kan IgG 100–200 test/saate kadar çalışır   Amerika Birleşik Devletleri
COVID-19 IgG/IgM LF yanal akış immünoassay Advagen Biyoteknoloji serum/plazma/tam kan IgG/IgM 10 dakikada sonuç   Brezilya
COVID-19 IgG/IgM Bakım Noktası Hızlı testi yanal akış immünoassay Aytu Biosciences/Orient Gene Biotech serum/plazma/tam kan IgG/IgM 2-10 dakika içinde sonuç   Çin, Amerika Birleşik Devletleri
COVID-19 IgM/IgG hızlı testi yanal akış immünoassay biyomedikal serum/plazma/tam kan IgG/IgM 15 dakikada sonuç   Amerika Birleşik Devletleri
Yeni koronavirüs 2019-nCoV için IgG antikor test kiti manyetik parçacık bazlı kemilüminesans immunoassay Bioscience (Chongqing) Teşhis Teknolojisi Co., Ltd. serum IgG   NMPA Çin
Tek Adımda COVID-2019 testi yanal akış immünoassay Kereviz Biyoteknolojisi serum/plazma/tam kan IgG/IgM 15 dakikada sonuç   Brezilya
qSARS-CoV-2 IgG/IgM hızlı testi yanal akış immünoassay Cellex Inc. serum/plazma/tam kan IgG/IgM 15-20 dakika içinde sonuçlanır, N proteinine özgü antikorlar Avustralya 31.03.2020, ABD FDA 4/01/2020 Avustralya, Amerika Birleşik Devletleri
COVID-19 Ag Solunum Şeridi yanal akış immünoassay (seviye çubuğu) Coris Bioconcept burun mukus bezleri viral antijen 15 dakikada sonuç   Belçika
DPP COVID-19 IgM/IgG sistemi yanal akış immünoassay Kimyasal Teşhis serum/plazma/tam kan IgG/IgM 15 dakikada sonuç ABD FDA 14.04.2020 Brezilya
DEIASL019/020 SARS-CoV-2 IgG ELISA kiti ELISA Yaratıcı Teşhis serum/plazma IgG/IgM N proteini için spesifik IgG   Amerika Birleşik Devletleri
Yerinde COVID-19 IgG/IgM hızlı testi yanal akış immünoassay CTK Biyoteknoloji A.Ş. (ABD) serum/plazma/tam kan IgG/IgM 10 dakikada sonuç   Avustralya
Diazyme DZ-Lite SARS-CoV-2 IgG/IgM testi ışıldayan bağışıklık testi Diazyme Laboratuvarları kan örneği IgG/IgM   EUA gerekli değil Amerika Birleşik Devletleri
KT-1033 EDI Roman Coronavirüs COVID-19 ELISA kiti ELISA Epitop Teşhisi serum IgG/IgM     Amerika Birleşik Devletleri
VivaDiag COVID-19 IgM/IgG hızlı testi yanal akış immünoassay Everest Bağlantıları Ticaret A.Ş. serum/plazma/tam kan IgG/IgM 15 dakikada sonuç   Singapur
COVID-19 IgG/IgM rapid test cassette lateral flow immunoassay Hangzhou Biotest Biotech Co. Ltd. serum/whole blood IgG/IgM results in 15–20 min Australia 4/4/2020 Australia
VITROS-Immunodiagnostics Products Anti-SARS-CoV-2 total reagent pack ELISA Ortho-Clinical Diagnostics blood serum/plasma IgG/IgM cannot distinguish between IgG/IgM US FDA 4/14/2020 United States
SARS-CoV-2 rapid test lateral flow immunoassay PharmACT whole blood/serum IgG/IgM results in 20 min, N protein, S1 and S2 subunits used as antigens   Germany
Standard Q COVID-19 IgM/IgG Duo lateral flow immunoassay SD Biosensor serum/plasma/whole blood IgG/IgM results in 10 min EUA not required South Korea
Standard Q COVID-19 Ag chromatographic immunoassay SD Biosensor nasopharyngeal swabs viral antigen results in 30 min   South Korea
iFLASH-SARS-CoV-2-IgG/IgM immunoassay Shenzhen Yhlo Biotech Company serum/plasma/whole blood IgG/IgM     China
MAGLUMI IgG/IgM de 2019-nCoV (CLIA) chemiluminescence immunoassay Snibe Diagnostic (China) blood serum/plasma IgG/IgM results in 30 min CE mark 2/2020 Brazil

Ayrı bir pencerede açABD FDA veya diğer ilaç düzenleme makamları tarafından verilen Acil Kullanım İzni.Git:

4. COVID-19 Teşhisi ile İlgili Literatür Eğilimleri ve Önemli Dergi Makaleleri

4.1. COVID-19 Tanı Testleriyle İlgili Literatür Yayınlarındaki Eğilimler

Daha hızlı ve daha güvenilir olan yeni COVID-19 tanı testlerinin geliştirilmesine yönelik önemli bir araştırma çalışması yapılmıştır. COVID-19 krizinin patlak vermesinden bu yana laboratuvar testleriyle ilgili 500’den fazla dergi makalesi yayınlandı.Figür​Şekil77 COVID-19 teşhisine odaklanan dergi makalelerinin sayısının son birkaç ayda önemli ölçüde arttığını ve bu alanda sürekli bir araştırma ve geliştirme çabasının olduğunu gösteriyor.Şekil 7

2020’de COVID-19 teşhisiyle ilgili dergi yayınlarının aylık eğilimi.

Tablo 3 , 31 Ocak 2020 ile 10 Nisan 2020 arasında yayınlanan 10 önemli dergi makalesini listeler. Çeşitli COVID-19 tanı yöntemlerini vurgulayan bu makaleler, dergi etki faktörü ve atıf/indirme sayısı dahil olmak üzere bir dizi faktöre göre seçilmiştir. .

Tablo 3

31 Ocak 2020 – 10 Nisan 2020 tarihleri ​​arasında COVID-19 Teşhis Testiyle İlgili Yayınlanmış On Önemli Dergi Makalesi

Başlık kaynak organizasyon test türü dijital nesne tanımlayıcı
Çin’de Coronavirüs Hastalığı 2019’da (COVID-19) Göğüs BT ve RT-PCR Testinin Korelasyonu: 1014 Vaka Raporu Radyoloji (26 Şubat 2020) Tongji Hastanesi, Tongji Tıp Fakültesi, Huazhong Bilim ve Teknoloji Üniversitesi, Radyoloji Bölümü, Wuhan, Hubei, Çin göğüs BT ve RT-PCR https://dx.doi. org/10.1148/radiol.2020200642
SARS-CoV-2 Enfeksiyon Teşhisi için Hızlı IgM-IgG Kombine Antikor Testinin Geliştirilmesi ve Klinik Uygulaması Tıbbi Viroloji Dergisi (27 Şubat 2020) Devlet Anahtar Solunum Hastalıkları Laboratuvarı, Solunum Hastalıkları Ulusal Klinik Araştırma Merkezi, Guangzhou Solunum Sağlığı Enstitüsü, Guangzhou Tıp Üniversitesinin İlk Bağlı Hastanesi, Guangzhou, Çin yanal akış immünoassay, POC https://dx.doi. org/10.1002/jmv.25727
Dışkı Örneği Teşhisi 2019 Yeni Koronavirüs Enfekte Pnömoni Tıbbi Viroloji Dergisi (3 Mart 2020) Solunum Departmanı, Jinhua Belediye Merkez Hastanesi, Zhejiang Üniversitesi Jinhua Hastanesi, Çin RT-PCR https://dx.doi. org/10.1002/jmv.25742
Improved Molecular Diagnosis of COVID-19 by the Novel, Highly Sensitive and Specific COVID-19-RdRp/Hel Real-Time Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction Assay Validated in Vitro and with Clinical Specimens Journal of Clinical Microbiology (March 4, 2020) The University of Hong Kong-Shenzhen Hospital, Shenzhen, Guangdong, The University of Hong Kong, Pokfulam, Hong Kong, and Hainan Medical University, Haikou, Hainan, all in China real-time RT-PCR https://dx.doi. org/10.1128/JCM.00310-20
Molecular Diagnosis of a Novel Coronavirus (2019-nCoV) Causing an Outbreak of Pneumonia Clinical Chemistry (April 1, 2020), Vol. 66 (4), pp. 549–555 School of Public Health, LKS Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong, China real-time RT-PCR https://dx.doi. org/10.1093/clinchem/hvaa029
Comparative Performance of SARS-CoV-2 Detection Assays Using Seven Different Primer/Probe Sets and One Assay Kit Journal of Clinical Microbiology (April 8, 2020) Department of Laboratory Medicine, University of Washington, Seattle, WA, and Vaccine and Infectious Diseases Division, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA, USA real-time RT-PCR https://dx.doi. org/10.1128/JCM.00557-20
Analytical Sensitivity and Efficiency Comparisons of SARS-CoV-2 qRT-PCR Assays medRxiv (2020), 1–18 Department of Epidemiology of Microbial Diseases, Yale School of Public Health, New Haven, CT, USA qRT-PCR https://dx.doi. org/10.1101/2020.03.30.20048108
ddPCR: A More Sensitive and Accurate Tool for SARS-CoV-2 Detection in Low Viral Load Specimens medRxiv (2020), 1–24 State Key Laboratory of Virology, Modern Virology Research Center, College of Life Sciences, Wuhan University, Wuhan, China droplet digital PCR https://dx.doi. org/10.1101/2020.02.29.20029439
Evaluating the Accuracy of Different Respiratory Specimens in the Laboratory Diagnosis and Monitoring the Viral Shedding of 2019-nCoV Infections medRxiv (2020) 1–17 Shenzhen Key Laboratory of Pathogen and Immunity, National Clinical Research Center for Infectious Disease, State Key Discipline of Infectious Disease, Shenzhen Third People’s Hospital, Second Hospital Affiliated to Southern University of Science and Technology, Shenzhen, China qRT-PCR https://dx.doi. org/10.1101/2020.02.11.20021493
Rapid Detection of 2019 Novel Coronavirus SARS-CoV-2 Using a CRISPR-Based DETECTR Lateral Flow Assay medRxiv (2020), 1–27 Mamut Biosciences, Inc.; Kaliforniya Üniversitesi, San Francisco, Kaliforniya, ABD CRISPR, yanal akış, RT-LAMBA https://dx.doi. kuruluş/10.1101/2020.03.06.20032334

Ayrı bir pencerede aç

Tartışılan tanı yöntemlerinin çoğu, son 20 yılda geliştirilen patentli teknolojilere ve viral enfeksiyonların teşhisi ile ilgili bilimsel dergi yayınlarına dayanmaktadır. SARS-CoV-2, SARS-CoV ve MERS-CoV’u da içeren Betacoronavirus cinsine aittir. Bu nedenle, yakından ilişkili olan koronavirüsler üzerindeki teşhis çalışmaları, SARS-CoV-2 enfeksiyonu için etkili teşhis tahlilleri geliştirmeye yönelik devam eden çabalara ışık tutabilir. SARS-CoV ve MERS-CoV tespiti ile ilgili patentler hakkında daha fazla bilgi Destekleyici Bilgiler II’de verilmektedir .

4.2. Tanı Başvurusu Olan Dergi Yayınlarında SARS-CoV-2 Dizileri

SARS-CoV-2 ile ilgili dergilerden elde edilen CAS REGISTRY’deki nükleik asit ve amino asit dizileri, teşhisteki potansiyel uygulamalar için analiz edildi. Tablo 4 , seçilen dergi makalelerini ve SARS-CoV-2 ile ilgili dizilerin karşılık gelen numaralarını listeler. Bu dizi kayıtları, primerler ve problar, gen ve genomik diziler, protein alanları ve epitoplar ve suş farklılaşması için potansiyel kullanıma sahip viral protein dizilerini içerir. SARS-CoV ile ilgili patentlerden alınan ek dizi bilgileri, Destekleyici Bilgi Tablosu S3’te verilmektedir .

Tablo 4

Teşhiste Potansiyel Uygulamalar için SARS-CoV-2 ile İlgili Dizileri Olan Dergi Makaleleri

yayın tarihi Başlık günlük nükleik asitler proteinler
2020 SARS-CoV-2 ve Diğer Solunum Yolu Virüslerinin Doğru ve Kapsamlı Tespiti için Nanopore Hedef Dizileme medRxiv 40 primer  
2020 2019 Yeni Koronavirüs (COVID-19) için Evde, Klinikte ve Giriş Noktalarında Tek ve İki Aşamalı, Kapalı Tüp, Moleküler Test ChemRxiv 6 COVID-19 LAMP primeri  
2020 Çin, Wuhan Dışındaki 104 Hastada 2019 Coronavirüs Hastalığının Bulaşma ve Klinik Özellikleri medRxiv 6 primer ve prob  
2020 Olası Yarasa Kökenli Yeni Bir Coronavirüs ile İlişkili Bir Pnömoni Salgını Doğa 4 50
2020 Çin’de İnsan Solunum Yolu Hastalığı ile İlişkili Yeni Bir Coronavirüs Doğa 1 10
2020 Bir Dizi Homolojisi ve Biyoinformatik Yaklaşım, SARS-CoV-2’ye Karşı Bağışıklık Tepkileri için Aday Hedefleri Öngörebilir Hücre Konağı ve Mikrop   51
2020 SARS-CoV-2’nin Laboratuvar Teyidi için Primer-Prob Setlerinin Karşılaştırmalı Analizi bioRxiv 20 primer, 10 prob  
2020 SARS-CoV-2’nin Nötralize Edici Antikorları ile Spike Protein Bağlanma Tahmini bioRxiv   3
2020 Amino Asit Çözünürlüğünde COVID-19 Antikor Etkileşimlerini Haritalamak için SARS-CoV-2 Proteom Mikroarray bioRxiv   11
2020 Yeni Koronavirüs Hastalığı 2019’un (COVID-19) Serolojik Tanısı için Rekombinant Nükleokapsid ve Spike Proteinlerinin Değerlendirilmesi medRxiv 12 primer  
2020 Dolaşan SARS-CoV-2 Suşlarından Kaynaklanan RBD Mutasyonları, Spike Proteininin Yapı Kararlılığını ve Enfektivitesini Artırıyor bioRxiv   8
2020 Teikoplanin 2019-nCoV’nin Hücre Girişini Güçlü Bir Şekilde Engeller bioRxiv 14 134
2020 SARS-CoV-2 ve SARS-CoV Spike Protein Reseptör Bağlama Etki Alanları ile Diferansiyel Antikor Tanıma: Teşhis ve Terapötik Tasarım için Mekanistik İçgörüler ve Etkiler bioRxiv   7
2020 ARTIC Ağının Multiplex PCR’si için SARS-CoV-2 Genom Dizilemesinin Kapsamını İyileştirmeye Yönelik Bir Alternatif Primer Önerisi bioRxiv 2  
2020 Amerika Birleşik Devletleri’nde 2019 Koronavirüs Hastalığı (COVID-19) Olan İlk 12 Hasta medRxiv 12 109

Ayrı bir pencerede açGit:

5. Özet ve Perspektifler

Geçtiğimiz birkaç ay, COVID-19 için teşhis kiti geliştirmede hızlı ilerlemeye tanık olurken, yarış daha da verimli laboratuvar teknikleri ve toplu miktarlarda dağıtılabilen uygun maliyetli, bakım noktası test kitleri geliştirmeye devam ediyor. Bu rapor, COVID-19 enfeksiyonunun tanımlanması için geniş bir moleküler genetik testler ve serolojik ve immünolojik testler sağlar. RT-PCR, viral RNA’nın saptanması için baskın teknik olmasına rağmen, izotermal amplifikasyon deneyleri, hibridizasyon mikrodizi deneyleri, amplikon bazlı metagenomik sıralama ve son teknoloji CRISPR ile ilgili teknolojiler dahil olmak üzere diğer nükleik asit tahlilleri de geliştirme aşamasındadır veya sonuçlanmıştır. onaylanmış testlerde 60Bu tür testlerin verimliliği de önemli ölçüde iyileştirilmiştir. Bu rapor aynı zamanda COVID-19 tanı teknikleriyle ilgili dergi makalelerinin trend analizini de sağlar. COVID-19 teşhisi için mevcut FDA EUA onaylı testlerin sayısı artmaya devam ediyor, ancak birçok yeni test hala çeşitli geliştirme aşamalarında. Ultra hızlı test kitleri ve bakım noktası testleri, tedaviye yanıt süresini hızlandırmak ve ayrıntılı laboratuvar ekipmanı ihtiyacını ve onaylı laboratuvarlarda yapılan testlerle ilgili bekleme süresini ortadan kaldırmak için geliştirmenin ana odak noktasıdır.

Küresel sağlık sistemleri COVID-19 salgını sırasında çalışmaya devam ederken, SARS-CoV-2 enfeksiyonunun doğru ve hızlı teşhisine yönelik acil ihtiyaç kritik olmaya devam ediyor. Özellikle, enfekte asemptomatik ve semptomatik bireylerin ve bunların yakın temaslılarının serolojik ve immünolojik testlerinin yüksek talep görmesi beklenmektedir. Şüpheli vakaları doğrulamak için moleküler genetik testi tamamlayıcı rolüne ek olarak, bu tür testler, hem enfekte bireylerde hem de aşı klinik deneylerine katılanlarda bağışıklığın dayanıklılığının yanı sıra bağışıklık tepkisinin seyri ve derecesi hakkında değerli bilgiler sağlayacaktır. Bu testlerin sonuçları epidemiyolojik değerlendirmeye yardımcı olabilir ve normal aktivitelere dönüşü yönetmek için kullanılabilir. Yine de, Duyarlılık ve özgüllük dereceleri de dahil olmak üzere serolojik testlerle ilgili birçok soru yanıtlanmayı beklemektedir. Son olarak, SARS-CoV-2’ye karşı antikorların varlığının gerçekten de virüse karşı bağışıklık ile ilişkili olduğu teyit edilmemiştir.

Özetle, kalan tüm soru ve zorluklara rağmen tanı testlerinin geliştirilmesinde önemli ilerleme kaydedilmiştir. Devam eden küresel çabalar, yeni tanısal test geliştirme ve dünya çapında test kiti teslimatını iletmek ve kolaylaştırmak için çalışıyor. Daha doğru ve daha hızlı tanı çözümlerini teşvik etmek için bir dizi kuruluş, test geliştiricilerini test ürünlerini bağımsız değerlendirme için sunmaya davet ederek veya daha fazla işbirliği için büyük yatırımlar sağlayarak bu çabaları desteklemektedir. İşbirliğine dayalı teknolojik gelişmeler de dahil olmak üzere benzer girişimler ve bilgi paylaşımı kullanıma sunuldukça, COVID-19 teşhis pazarının gelecekte de gelişmeye devam etmesi muhtemeldir.Git:

Teşekkür

Manuel S. Guzman, Dr. Gilles P. George ve Dana Albaiu’yu bu çalışmaya, özellikle de Dana’nın eleştirel incelemedeki çabasına yönelik cesaretlendirmeleri ve destekleri için içtenlikle takdir ediyoruz. Bu makalenin hazırlanmasındaki yardımları için Steve P. Watkins’e ve yayın sürecindeki desteği için Cristina Tomeo’ya teşekkür ederiz.Git:

Notlar

Bu makale en kısa sürede 1 Mayıs 2020’de yanlış referans 34 ile yayınlanmıştır. Bu referans şimdi bu güncel sürümde düzeltilmiştir.Git:

Mevcut Destekleyici Bilgiler

Destekleyici Bilgiler https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscentsci.0c00501 adresinde ücretsiz olarak mevcuttur .

  • (1) COVID-19 teşhisi için seçilmiş moleküler genetik testlerin açıklamaları, (2) Tablo S1 ve S2, şu anda mevcut olan 200’den fazla moleküler, serolojik ve immünolojik teşhis testini vurgulamaktadır, (3) ilgili koronavirüs teşhisi için patentli teknolojinin öne çıkan özellikleri SARS-CoV ve MERS-CoV gibi ve (4) teşhiste potansiyel uygulamalar için SARS-CoV ile ilgili dizilere sahip seçilmiş patentler ( PDF )

Git:

Yazar Katkıları

# LJC ve LVG eşit katkıda bulundu.Git:

Ek materyal

oc0c00501_si_001.pdf (1000K, pdf)Git:

Referanslar


ACS Central Science’dan makaleler burada American Chemical Society’nin izniyle sağlanmaktadır.

Pages: 1 2 3